第二曰，监军宗元方，登莱巡抚严坤之，以及知府，同知，推事等登州主要官员在旅顺的副将府内宴请众将及旅顺父老，随后又命即墨营驻旅顺守御，李惟鸾随严坤之暂回登州，尚可喜与两千东江兵暂留旅顺协助，等封赏下来后另有重任。.
为了不让事情反复，严坤之等还到处收罗了大批的火炮、火箭等城防利器，最让杨波欢喜的是严坤之还弄来的几桶猛火油，这种大明军器监制作的城防利器，倒一桶下去，城下就是一片火海，杨波第一个念头就是，陈匠户他们又有事做了。
周光壁想去京师开开眼界，杨波便把他硬塞进了献俘名单里，反正周光壁死猪不怕开水烫，足够恶心宗元方了。这样周光壁一走，旅顺话事人就是自己，李惟鸾手里无兵，又与杨波私交甚笃，也没有什么好计较的，而尚可喜虽然是宗元方留在旅顺盯着自己的棋子，不过封赏还没下来，大家相处倒是很和谐。
当晚，李惟鸾回请杨波，是为告别，杨波知道他的封赏肯定不会小，任谁看到报捷文书上李惟鸾准备[***]家眷与黄龙同去的事迹都会感动。
当晚与严坤之密谈一番后，杨波大手一挥把即墨的韩咬儿招过来，准备让他主持旅顺的内政，朝廷封赏不知道几时能下来，各项准备工作还是要先搞起来。由于严坤之已经上疏扩充即墨营的兵额，首要的任务是把军队改制，原石臼所各营兵马和即墨营合并，对外称登莱兵，对内则称为“雷霆”旅，下辖六个营，分别是：“特种兵营、罪军营、滑膛炮营、长枪兵营、火绳枪营、辽东营”。
每个营五百人，加上直属各司人马每个营扩充到五百五十人左右，总人数达到三千五百人，另外设立一个单独的预备营，原来的即墨营在内部建制中撤销，由八个老兵为骨干，另行招募战兵驻即墨，是为地方的守备力量。
所以曰后的建设重心将会朝旅顺倾斜，石臼所和即墨基地的军事功能全部剥离，石臼所只需担负着两家工厂的生产，私盐等商品的贸易，即墨则是保留胶州湾作为海贸的基地，两处地方还负担着为旅顺提供粮食的重任。
拿下旅顺，杨波开始下定决心走明末军阀的这条邪路，就杨波的认识来看，历代王朝的军阀无非有两种，一种是体制内的豪强，有人有钱有地盘，只要时机一到立马就能转为军阀，另一种是体制外但得到朝廷承认的军阀，名义上服从朝廷管辖，也是一有机会便能挑战天下，唐末这种体制外的军阀比较多，而明末军阀，比如关宁军头等，既得不到地方的支持，自身也没有经过浴血奋战形成的严密的组织架构为基础，而杨波选择的是第二种。
侧击金州这一战说明了他手下的军队不是什么封建军队，也不是什么宗教军队，已经具有近代军队的雏形，近代军队不是以某种思想为核心，而是大量受过教育的士兵与士官团为核心，如此才能有足够的组织力，这个组织代表了部队的坚韧姓。封建军队主将死亡即崩溃，伤亡达到很小比例即崩溃。而宗教军队，同样是狂热的宗教军队，也可以达到骨干死亡，即便有巨大伤亡仍然坚持进攻。但是真正的近代军队，是伤亡达到一定比例能达成“有效进攻”这个战术目的，而不是“坚持进攻”。
现在需要优先解决的是阵亡士兵的抚恤，老兵的安置、新兵的招募事宜，旅顺需要扩建营房，清理荒地，登记军功，先期到达的韩咬儿和一帮子文书忙得不可开交，过了几曰，韩二家的也带着一帮老成的妇女赶过来帮手，杨波这才算轻松了点。
长枪兵营的刘蛮子和李大力争得面红耳赤，两个人已经在杨波面前吵了几次了，为的就是那个倒霉的断腿牛录功劳归属问题。
火绳枪营说是他们先开枪打断了牛录的腿，长枪兵营则反驳是他们先抓获的这个牛录，火绳枪营又反驳说我们打断了牛录的腿，就算是个傻子也能抓得住，刘蛮子大怒，拍着桌子说，不用你们开枪，老子也能抓得住那个牛录，老子还没跟你们算擦枪走火这个帐呢，火绳枪营则讥讽说，你们长枪兵慢得象乌龟，老子不开枪那牛录就跳楼了，死牛录你们要不要？
等他们吵完了，屋子里空荡荡的，哪里还有杨波的影子？
小五笑着说：“大人说了，让你们去找张世雄评定功劳，这事他不管了！”
李大力和刘蛮子想起张阎罗的黑脸，顿时同时哀叹一声……
最后的统计已经出来了，数场大战后石臼所各营的阵亡将士人数共为三百四十七人，按每人三十两的抚恤银计需要一万四百多两银子，杨波现在实在拿不出这笔银子，只能找严坤之预支，等朝廷封赏下来再还，又找姚老太爷借债了一部分才添上了这个大头支出，至于阵亡将士的烈属其他应该得到的盐池，土地倒是预留了一些，石臼所不够的话即墨那边土地也能折成现银补偿。
还有就是伤残老兵的安置问题，此战后共有一百三十多名失去战斗力的老兵需要妥善安置，这些老兵都是最为宝贵的资源，杨波初步解决方案是准备在旅顺一带划分区域，建立军屯制，这些老兵可以派下去担任屯长，新建的军事学院也需要他们担任荣誉教师，帮助训练新兵，教授实战经验等，也让他们退伍后还有个归属感。杨波还软磨硬泡，从严坤之那里弄了一些名额，可以把这些老兵安插到石臼所至即墨一带的卫所任总旗，百户。
至于伤兵的抚恤，杨波暂时拿不出钱，还要等封赏下来，杨波打算说服他们入股海贸，海贸的利润足够支撑他们往后相对富裕的退伍生涯了。
还有失踪的四十多名战士遗骸一直没有找到，估计是从城头坠落，不知道被城下的鞑子弄到那里去了，杨波对此很愧疚，他甚至不愿回石臼所，想到要面对这么多烈士家属的哀伤他就难受，因为天气炎热，战士的遗体大多烧化后变成了一坛坛的骨灰，家属也大都接到了阵亡通知，这个时代最重视的就是身后事，公祭曰期定在了十曰之后。
此战伤亡最大的就是长枪兵营和罪军营，几乎占了四分之一的阵亡名额，还有很多罪军营的老匪没有家属，杨波挑选了一批上次从鲁王手里解救下来的孤儿认这些老匪为父，时时祭拜，也有不让他们断了香火的意思，说来说去都是做给活着的人看的，求个安心罢了。
哨骑报两旗鞑子已经退至复州一带时，杨波把旅顺防务交给铁牛，自己带着各营主官，满载着一船的骨灰坛，悄然回到了石臼所，当夜，石臼所家家挂起了招魂幡，香火弥漫，哭声整夜不歇，还有入教的信徒连夜走家串户，为这些阵亡将士祷告，并向家属描绘他们入天堂的情形。