除了微缩模型的拍摄之外，特效镜头的拍摄也正式开始了，也就是绿屏拍摄的部分。虽然好莱坞的科幻片使用这项技术宜宾颇有时日，但是显然对英国电影界而言，这还是项少见的新鲜玩意。
看着实景搭配绿屏的摄影棚，一众小演员纷纷发出“哇哇”的惊叹声。这里是拍摄哈利·波特的第一场魁地奇比赛的现场，一个四周围起的蓝色房间里，吊满了各种亚威钢丝。总计十四名小演员的现场，显得非常繁忙。
这可以算是全片特效镜头最多的场景之一了，也幸好希德早从几年前的《温暖的尸体》开始，就对火狮的御用制片团队进行这方面的调教，如今进行《哈利波特与魔法石》这样大量运用特效镜头的大制作，也不至于手忙脚乱。
因为魁地奇比赛有大量的飞天镜头，背景的城堡和森林都是是先用微缩模型进行拍摄，而球场本身则是采用了实景拍摄加电脑动画的方式。其中坐满观众的各个竖形桩的上半部，是实景拍摄，在其周围则布满绿屏，以便进行后期特效的加入。
在这之后，再进行小演员们骑扫把比赛的镜头拍摄。
不管是电脑生成的数个皮球，还是小演员们在绿屏上让人眼花缭乱的穿插表演，都在火狮旗下的法国MacGuff和工业光魔的合力之下，一部分一部分的稳步拍摄。
虽然这样在摄影棚内拍摄的绿屏镜头，看起来颇为复杂，但实际上这还并非最大规模的特效拍摄。
实景结合绿屏的拍摄才是，当希德等人在约克市中心的肉铺街，拍摄对角巷的场景时，使用了巨大的绿屏来遮挡远处的场景，以进行后期的拼接。
这也是数字化拍摄的好处和便利，数字格式让镜头的构建，变得前所未有的灵活起来。剪辑师团队和希德可以自由改变或移动布景、人物和灯光，就像PS照片一样PS影片，简直是新时代的光影魔术。
也正是这样的便利，让希德决定在之后火狮的幻想大片计划里，都要尽可能的使用数字摄影机及其配套的剪辑、后期系统。
当希德进行特效镜头的拍摄时，由副导演贾斯汀·林领衔的B队，也在英国其他的摄影场地进行大量的辅助镜头拍摄。所谓辅助镜头，就是指那些除了主要情节和角色的主镜头之外的，相对不重要的镜头。
这也是大制作影片的常规规则，导演拍摄主镜头，而副导演则拍摄不重要的辅助镜头，一方面能减轻导演的工作量，让其把精力集中在真正重要的部分。另一方面两组同时行动，也能提高效率，节省拍摄时间，有利于电影公司节省成本。
一般而言，只有那些事必亲躬的大导演，才会自己事无巨细的负责一切拍摄工作。或者说，几个完美主义者的顶级大导演，都有这样的倾向。就像斯皮尔伯格和詹姆斯·卡梅隆，以及后来的诺兰。
而希德这次之所以依常规行事，一方面是为了节省拍摄时间，另一方面也是为了锻炼贾斯汀·林的导演才能，在《哈利波特与魔法石》开拍之前，希德恶作剧似的让他拍摄了那部有名的，两个场景一部科幻片的《这个男人来自地球》。