整个事件经过就是如此，当时的许多科学家认为法蒂玛事件中的目击人中大部分是天主教徒，因此所谓“玫瑰圣母法蒂亚”及其所传递的让人们忏悔的信息都是因宗教的狂热和集体幻觉所致。
然而,少数人的幻觉尚可解释，可七万人集体梦幻，未免过于奇妙了，而且，这里面排除去一些宗教的成份后，也存在有许多疑点，如太阳的变暗，一个圆球发光体的飞行等等。因此，不能不加研究地武断地置此案不理。
法国国家科学研究中心研究员，天体物理学家皮埃尔.盖兰先生曾写道:“对法蒂玛现象从心理学或视角来解释，都不能说明下面这样一个事实:为什么离栎树数十公里远的一些村子里也有很多人看到在法玛蒂方向，“太阳”旋转着弯弯曲曲地下降，继而又升向群山之巅能？如果这是一种幻觉的话，那么，周围村子的人也发生了幻觉不成？……
不论是精神病科大夫，也不论是物理学家，他们都没有认真地阅读有关法蒂玛事件的材料，这是因为他们连做梦也没想到，法蒂玛竟是一个排除一切宗教解释的圆形发光实体出现的地方。这个发光的圆球，使七万个目击者错误地把它当成了太阳，但他们对它的描绘是客观的、老老实实的……”
从这段话里有人也许已看出，盖兰先生除了发生的疑问外，还做了一个结论:即这所谓变暗的“太阳”并不是做为宇宙中恒星之一的太阳，而是指使七、八万个目击者错认为是太阳的发光圆球!这个结论的正确性我们是可以证明的，因为在法蒂玛事件发生的那一天，即1917年10月13曰，世界各天文台都把望远镜对准了宇宙空间，可什么异常现象也未发生，因此，我们伟大的“阿波罗”在那一天并未发生变化这一点是确信无疑的了。因此，只能说那天，只有法蒂玛村附近的地方出现了那一千古奇观，而其它地方则没有出现。
另外要注意的一点是：事件发生时，七万多人由于大雨淋湿的衣服如此之快地被晒干，这只有具备足够大的能量的物体才有可能，而这种物体要又具备有太阳的特征，只有在云层中存在一个直径达几百米的球形发光物体才行。这足以证明盖兰先生的推断。写到这里，读者应该已很明了了，这显然是一次万人目击的UFO事件。
这是一种近乎神话般的解释，但通过一些已知的事例比较而想到的这一解释，应该说是具有一定的依据，并不是凭空臆想出的。
当然，即使是这样的解释，也还有一些疑问远没有解释清。如那位“夫人”临走前嘱咐众人要继续“忏悔”，这是什么意思？要么吕西在这句话中对几万个天主教徒说了假话，要么吕西的这句话确实是“夫人”讲给她的。若是前者，无非是吕西受周围这些天主教徒影响较深，为了符合这些人的平常的意愿而说了这么一句教徒们经常说的（是一句假话），我的解释是有效的：如果是后者的话，那自然扯到了人类、宗教、及飞碟这三者之间的关系问题上来，那我对法蒂玛事件所基于的假设及解释将不自觉地陷入到厄里希·冯·丹尼肯所做的圈套中去。
保守天主教徒对法蒂玛圣母的信息中反共产主义的内容非常热心。圣母蓝军（BlueArmyofOurLady）是一个由天主教徒和非天主教徒组成的组织，其成员认为通过挚诚的每日的祈祷可以达到世界和平和结束共产主义的错误。批评家认为1952年拍摄的电影《天使显灵》过分地将当时葡萄牙政府中的社会主义者和其他左派边线为显现的“对手”。他们认为由于当时的政府主要是受共济会的影响，而不是受社会主义者的影响，政府对显现的反对主要是为了使得政教分家，而不是出于无神论或者共产主义思想。其他批评家说只有显现的反对者才会相信这样的。
对于这个事情我没办法解释。
世界上离奇的事件太多，科学无法解释的现象也比比皆是，就像下面这些离奇的失踪事件，你简直都不敢相信这世上真的发生过这种事情，但这些却都是不争的事实!你见过一个踢足球的少年上一秒还在球场上踢球，下一秒却已经脱离了这个世界;你敢相信“泰坦尼克”号海难船长失踪80年后离奇再现，容颜却和80年前一模一样……这到底是怎么一回事，让我们一探究竟!
1999年7月2日，在中美洲的哥伦比亚约有一百多名圣教徒，到阿尔里斯山的山顶去朝拜。这伙圣教徒相信1999年8月“世界末日”来临，他们上山去祈祷上帝的拯救。
谁知这伙教徒上山以后再没有下来，就此失踪了。此事惊动了哥伦比亚，他们派出了大批警察在阿尔里斯山顶四周大面积寻找，并出动了直升飞机。近一个月，整个内华达山区查遍，但不见一点踪影。