到了年底曹操重返谯县，可他一走就出事了。
当时曹军内部正在进行换防，乐进、张辽、李典等部陆续从其他战场赶过来，但还没等他们完成布防，曹操控制区内部出现了叛乱。叛乱发生在曹操控制区的九江郡六县、潜县等地，这里是现在的皖西地区，位于大别山区的北部，自古以来这里民风强悍，加上地处山区，适合打游击，在古代这一带经常是强人出没的地方。
早在官渡之战前后，这一带就有许多变民，规模比较大的有陈乾、梅成、雷绪几股，当时曹操与袁绍相持于官渡，无力东顾，派刘馥担任扬州刺史维持局面。刘馥挺有本事，他虽然是光杆司令一个，但很快打开了局面，使曹操控制区的面积一点点扩大，又重修了合肥城，给曹操与孙权对抗创造了条件。
刘馥开拓扬州有一项重要措施是招安变民，梅乾、陈兰、雷绪都先后被刘馥招安了，从建安五年（200）前后一直到建安十四年（209），这些人倒也挺老实，一直没有闹出过什么事。
这中间刘馥的个人威望起了不小的作用。刘馥去世后，曹军与孙权打了好几个月的仗，当地百姓遭受到巨大的损失，曹操来到合肥后虽然推行了一系列恢复生产、促进社会发展的措施，但民心不稳已成现实。
曹操也看到了这个问题，他对经营好淮南一度失去了信心，甚至想把淮南民众迁到北方去，以避开战乱。
曹操征求蒋济的意见，蒋济表示反对。曹操对蒋济说：“当年我与袁绍在官渡相持，整体迁移过燕县、白马县的民众，似乎并非不可行。”
蒋济这个年轻人很熟悉当地的情况，他回答：“那个时候我弱敌强，不迁走必然被敌人占去。现在情况完全不一样，我们的势力足够强大，民众不会有其他想法。同时，老百姓都有怀土情结，不愿意迁徙，如果硬力推行，大家必然心中不安。”曹操经过考虑，最后没有采纳蒋济的建议，下令从江淮之间进行大规模人口迁移。此令一下，果然引起民众的恐慌，有十多万人跑到孙吴控制区。
曹操赶紧下令停止了移民活动，再次见到蒋济时，曹操曾向蒋济当面做过自我检讨。
陈兰等人再次叛乱正是在这种大背景下发生的，叛乱影响到刚有点规模的合肥基地的安全，看到这种情况，已经身在谯县的曹操立即调兵遣将，镇压叛乱。
当时大的叛乱有陈兰等三股，叛军活跃的主要地区是九江郡的六县、潜县，叛乱的规模相当大。曹操下令成立临时“剿匪司令部”，级别相当高，由夏侯渊行领军，下辖于禁、臧霸、张辽、乐进、张郃、牛盖等部，曹军最精锐人马和最顶尖将领几乎有一半参加了此次行动。