明军很顺利的进入了伊犁城，然后拿着扎拉明星的降书顺表感到百里之外的可汗浮图城接受那里的土地。吐鲁番的将领们都知道明军入主已经不可逆转，再加上见到了太子爷的亲笔降书，又知道国王已经战死，再也没有什么好说的，全体放下武器接受明军入城。明军几天之内就全部占领了吐鲁番的土地。整个西域尽归明朝所有。
易土生除了贴出安民告示，严厉约束自己的军队之外，还封了扎拉明黄和扎拉明星官职，命令尚之信先一步把所有的王公大臣亲属亲眷全都押回北京，自己留在伊犁城内稳定局势，两个月后也开始返程。
这次征战立时将近三年，搅『乱』了俄国的证据，吞并了整个大草原还有西域各国大大的稳定了明朝的边疆，从此之后再也没有多少国家可以和伟大的明朝分庭抗礼了，趁着现在没有战事，易土生决定赶紧回国，去解决一下明朝内部的危机。他要是再不回去，只怕国内又要有什么不好的谣言了。
易土生行军以来一直都把小皇帝带在身边，现在也应该是让他回去的时候了，这小子已经七八岁了。再说，士兵们也非常的想家，在这样征战下去不是办法，必须让他们休息才可以。所以易土生开始动身。
易土生命令陈子龙和应坤总督吐鲁番事务，就在伊犁城设立‘西域都护府’，小事儿又两人负责，大事儿还要给他传讯！[]明宦之风流无边906
一个月后当明朝的大军刚刚走出了沙漠，就接到了由河西走廊转来的信件。信件是从京城加急赶来的，写信的人是牛金星。
易土生习以为常的打开了信件，可是触目之后顿时有些心惊，牛金星经常给他来信报告国内的事情，但是这一次的信与往常不同，信上说，明朝的几名高官，也就是易土生的那些亲信，这几日来遭到了好几次刺杀，虽然由于易土生留在京城的那些高手帮忙，刺客没有能够得手，但是现在人心惶惶了，请皇父摄政王立刻返回京城想办法稳住局势。
易土生心中大怒的同时也正在想到底是什么人在兴风作浪呢？自己已经把左良玉和太后党的余孽全都抓住了，为什么还会有人出来刺杀，难道是外国的势力，莫非是俄国人，或者是天竺人！这些想法让他开始焦躁不安，最后他决定暂时摆脱大军，先一步回到京城里去。
第二天易土生就宣布军队暂时由尚可喜和祈秉忠、刘宗敏三人负责，而他率领赵率教等将领火速的返回京城，只带三万骑兵。而且全都挑选精兵和良马，要求以最快的速度返回目的地。
这三万人马出了河西走廊，渡过长江，然后一路向北，经过河南河北又过了一个月的时间，人困马乏的时候，来到了京城之外的通州地界。易土生派人立即进京通知牛金星祖大寿等人，让他们准备迎接胜利之师。而且他也做了准备，谨防经常有变，三万大军时刻也不离开自己的身边。
易土生坚信，就算是有什么人造反了，凭借自己手下三万精锐，也可以把北京城打下来。只要后续部队一到，天下还是自己的。因此他并不忙着进城，而是休整了三天，让士兵们缓过神来，然后进城。
还好，他预料中的事情并没有出现，牛金星祖大寿等人满面春风的迎了出来，还有满朝的文武，加上太皇太后陈倩儿也在其中。
欢迎的场面非常盛大，比前几次都大，由于易土生提前下了通知，几乎附近州县的官员都来了，那场面真是相当的壮观，将近有两万名官员跪倒在他的脚下，山呼千岁，太皇太后居然亲自给他牵马把他迎入宫中。没有一个人干出来反对的。