崇祯五年，夏。
入崇祯五年以来，大明天下依旧纷乱不休，山东辽兵叛乱愈演愈烈，孔有德大败登莱总兵张焘，在耿仲明、陈光福等登州守将的里应外合下攻陷登州，右军都督府都督同知张可大杀其妻妾后自尽，山东巡抚余大成被俘，登莱巡抚孙元化自尽不成亦被俘虏，城中葡萄牙教官十二人阵亡。
孔有德念及孙元化温恤之恩，自称都元帅，欲奉孙元化为王，孙元化宁死不从，孔有德无奈，将俘虏的一众官将放还，铸造大印、伪授官爵，还遣使联络皮岛、石岛、旅顺等地的毛文龙旧部，意图割据山东半岛，一时声势喧天、朝野震动，自此，以内阁首辅周延儒为首的招抚派破产。
崇祯又羞又怒，悔不听杨嗣昌之策，将孙元化、余大成、张焘等人全数下狱，令东江总兵扫荡东江叛军，令总兵杨御藩统通州兵驰援莱州，又令原天津兵备道朱大典巡抚山东、司礼监秉笔高起潜监军，抽调辽镇祖大弼、祖宽、吴襄等部两万一千余辽镇军兵入山东平叛，战事延绵至今。
山东之外，陕西也不太平，老回回与李部司合兵，盘踞陕西、甘州、宁夏边界地区，组织回汉百姓生产自救、招募流民屯田、公审地主官绅，清丈分田、清租清贷，被剿饷和租贷压得透不过气来的百姓纷纷投奔，老回回一跃成为陕西农民军中的领袖人物。
刚刚接任陕西巡抚的熊文灿对此极为忧心，在弹劾洪承畴的奏疏中就写道：“臣闻秦人言，‘往日怕回夷杀我，今闻其推衣食以恤我、分田地以养我，诛恶绅贪官以伸正义，岁征粮税，无差役杂赋滋扰，我与其饥饿而死，或死于棍棒刀兵之下，毋宁随回夷而去，犹可得一活命也！’洪承畴坐视回贼、李贼合兵，知其蛊惑百姓而无动于衷，以至回贼成势难制，敷衍欺瞒，其罪当诛！”
但没人理会他的奏疏，因为洪承畴刚接任山西巡抚便立下了大功，“武乡贼闻洪巡抚入晋，惊惶无定、皆言必死，待洪巡抚领兵至太谷县，贼更为惊惧，皆言‘洪屠若至，我等安有命焉？不若弃沁州南向，尚能活命也！’贼众尽弃沁州南逃，一部自顺沁水河南逃沁水县，一部则向西盘踞运城，沁州自此光复矣！”
洪承畴“光复”沁州三城，成了崇祯五年至今朝廷的唯一一抹亮色，崇祯得报欣喜若狂，加洪承畴兵部尚书衔、太子太保，赐尚方宝剑，令其领兵继续追剿武乡贼、围剿山西境内的流寇匪贼。
洪承畴心里清楚他这“收复沁州”的功劳有多少水分和猫腻，以“沁州局势未定，尚有武乡贼残部遁入太行山伺机造乱，且山西贼势猖獗、官军人马粮草不足”为由退回太原，只令贺人龙、尤世禄等人领军扫荡那些零散的农民军反王。
崇祯对此很不满，一日数封谕旨让洪承畴乘胜追击、剿灭逃遁的武乡贼和盘踞辽州的闯贼，甚至还准备派东厂掌印王德化来山西监军。