小五郎也大叫，“我不吃这一套！”三上村长走向外面，显然他没有听过千钧的名声，“联络船要是没有我的许可，是不可能发船的。我看今天晚上，你们好好考虑一下，哈哈……”三上离开后，毛利侦探非常气恼，“可恶！”小兰有些紧张，“看样子我们好像到了一个不讲理的地方了。”晓月哼了一声，“在海上，没有人不讲理能超过海军部那些家伙，对吗，千寻？”千寻露出狐狸一般笑容，“爷爷昔日手下的那些海上自卫队的朋友们，最喜欢干的事情，就是无故拘押船只，不听话的岛屿片板不让下海。”柯南立即明白了，“喂喂，你们不会打算找……”千钧大笑，“这就叫恶人自有恶人磨！这个村长明显不安好心，他要敢鼓动村民袭击我们，我就把他宝贝女儿抓来做人质。”
千钧起身离开，说要去做些准备工作，“我可不想大家步上水军教授的后尘。”千寻用手机打通了爷爷的电话，千水一木问清了岛屿的所在，“好了，你就等好消息吧，海军自卫队的人早就想找点刺激了！到时候，我让他们顺道把你们接回去。”晓月犹豫了一下，觉得还是不要通知目暮警官他们了，警察系统和海上自卫队系统毕竟相差较大，万一闹出矛盾就不好了。
说话之际，木下五郎推门进来，“真对不起，我们村长之所以急着想把金块找出来，完全是希望把小岛变成观光胜地。”晓月冷笑，“观光胜地和金块完全是两码事，村长根本是想独吞。”小五郎忽地站起来，“真是受不了了！”木下五郎急忙道，“请你们放心好了，我明天就安排船只把几位送回本土去。不瞒几位，小型的渔船我还是可以安排到的。”小兰大喜，她早就不想在这个有水军作祟的敷岛待下去了，“太好了！”毛利侦探拒绝，“不行，我现在还不能走……”小兰急忙劝解，木下也道，“毛利先生，你不要这么说，要是再待在这里，你说不定会发生危险的。”
小五郎生气，“我要是这么走了的话，那我天下闻名的侦探毛利小五郎的名字往哪里摆？”柯南大叫，“说的好，叔叔！”木下五郎失望地离开了。柯南急忙追出去，询问浜田的情况，木下说浜田原本不是小岛上的人，是在龙神号事件之后，就突然出现在岛上，声称想找个工作，那个时候灯塔守卫的工作刚好没人做，他就留了下来。木下疑惑，“小弟弟，浜田有什么不对吗？”柯南急忙说没有，“我只是觉得他有点怪怪的。”说完，柯南喊了声再见跑回去了，木下却露出古怪的笑容。
晚上，大家准备休息了，发现千钧到外面后一直没有回来。不过，大家都没有替他担心，能够伤害到千钧的人非常罕见。不久后，大家都进入梦乡，深夜中，小五郎还在梦中念叨着冲野洋子的名字，小兰也睡熟过去。晓月和千寻也在里屋安静入睡，柯南悄然离开，来到灯塔下。猛然间后面有人伸手捂住柯南的眼镜，柯南吓了一大跳，回头一看，原来是三上铃。柯南恼怒，“不要吓我，好不好！”三上铃也生气了，“干嘛这么凶，我是看你一个小孩子大晚上出来，所以才想过来陪你的。”柯南发现灯塔下有人开门，急忙拉住三上铃躲到灌木丛后。三上铃趴在柯南怀里，脸色通红，“干什么啊？我们的关系还没到这一步吧！”
柯南彻底无语了，上原康夫从里面走过来，柯南急忙示意噤声。上原离开后，柯南和三上铃进入灯塔下面的房间，里面乱成一团。柯南道，“原来上原到这里搜东西。”随后柯南闻到汽油味道，发现油桶却很轻，岛上又没有摩托车和汽车，柯南点头，“目标果然是大叔。”柯南听到动静，向灯塔上方跑去，三上铃大叫，“柯南，你不要乱跑啊！”紧跟着追上去。到了灯塔顶部，柯南发现了架子上的长筒望远镜，“果然，千钧说的没错，白天的时候的确有人在这里监视。”柯南走过去，想跳起来来看看，结果都失败了。
三上铃笑道，“你不用跳了，就算看到也没用。因为那个是对着那座山的，根本没有什么好看的。”柯南疑惑，“太奇怪了吧，照理来说，灯塔上的望远镜应该对着大海才是。这个望远镜怎么会对着那座山呢？”柯南猛然发现架子下刻着字，“龙神号”。柯南立即断定，浜田幸二跟龙神号有关，而且调查龙神号会造成他的困扰，所以他才会对付毛利大叔。柯南回过神来，“糟了，叔叔和小兰他们危险了，偏偏千钧又不在……”柯南急忙向下面跑去，三上铃很生气，紧跟着追上去，“可恶，等等我！”
宾馆，身穿盔甲的武士用脚将轻轻踢毛利侦探，小五郎睁开眼，“干什么啊？”水军武士挥刀砍下，小五郎窜了出去，躲过致命一击。蹲在角落里，小五郎惊恐至极，“你想干什么？”听到声音，小兰睡醒朦胧，从隔壁开门进来，“爸爸，怎么了……啊！”小五郎大叫，“小兰，你们别过来。”晓月和千寻推开发愣的小兰，拿着冷月剑和青冥剑走出来，水军武士立即转身逃走了。小五郎大为愤慨，大喊着追了出去。小兰阻拦不及，晓月发现哥哥还没有回来，千寻也发现柯南也不见了。
小五郎一路紧追，“可恶，屁股这么痛，根本跑不快，千钧那死小子，关键时刻不知道跑到哪里了！”经过一番追逐，武士跑到了码头附近放着龙神号的仓库，毛利气急败坏地追了进去，“这下子，你跑不掉了吧！”然而，武士突然出现在小五郎身后，用刀柄将其击晕。小兰、晓月、千寻走出门外，刚巧碰到回来的柯南和三上铃，小兰很是生气，“你跑到哪里去了？我担心死了。”柯南问出什么事了？小兰露出惧色，“刚才爸爸被水军的幽灵给攻击了！”柯南大惊，这时港口的吊钟敲响了，表示岛上发生了大事。大家一起跑过去询问状况。
接着，大家都来到仓库，外面围了很多人。千钧也从远处赶来回来，听到钟声，也到了仓库这里。晓月和千寻一顿埋怨，千钧笑着解释说等会有好戏看。千钧上前询问，发现一个老警察和2个男子押着小五郎从里面出来。柯南和小兰叫出声来，三上村长也很惊讶，“到底怎么回事？”村民甲说毛利侦探把灯塔守卫浜田杀了。柯南恼怒，“什么？”小兰很生气，“我爸爸杀人，怎么可能？”千钧冷笑，“说话要讲证据的，你们谁亲眼看见了？”大家都是一愣，村民乙说，“你们要不相信，自己看吧！”
大家一起过来，发现身穿盔甲的浜田被人用武士刀贯穿了脖颈，鲜血还在下流。大家的脸色都很难看，年老的驻在警察说，“刚才我追到这里的时候，这个侦探已经昏了过去，而浜田先生就是这个样子了。”小五郎大吼，“真的不是我，你们要相信我。”村民们开始骚动，“太可恶了！”“都是他们这些外来人乱来，水军的灵魂才会生气的。”柯南大急，“叔叔绝不会做出这种事情的，但照这个情况看……”千钧大吼，“不准随便侮辱别人，毛利侦探可是你们村长请来的！”
三上村长却说，“毛利先生，就算你是名侦探，我还是不能看见你杀人而放你一马。”小五郎解释，“我在睡觉时，突然有人摸黑攻击我，接着我就追到这里，后来就突然被人从后面打晕了。等我醒来的时候，就是这个样子了。”糊涂警察说，“也许是你搏斗的时候，把他浜田杀了。”小五郎大吼，“我没有杀他！”木下五郎说，“浜田先生这身衣服，不是放在水军资料馆的那副盔甲吗？他怎么会做水军装扮啊？难道又是水军作祟？”三上武男恼怒，“不要在这里妖言惑众！”村民们都相信了木下的话，“一定是这样，水军附在了浜田身上。”村长很生气，“什么嘛，水军作祟根本就是迷信。”村民丙问，“那为什么浜田会穿上这幅盔甲？”
驻在警察说，“现在争论这个根本于事无补。”柯南走过去观看，死者的致命伤在脖颈上。浜田的袖子破碎，手腕上有被帮过的痕迹。千钧走过来，撩开衣襟，“死者身上都是刺伤，看样子被人严刑逼供过。”木下五郎走过来，“小孩子不应该看这些恐怖的东西吧！”柯南答应一声，却跑到龙神号里查看，小兰觉得他太失礼了，就跟上去阻止，“你随便跑进去，人家会生气的。”