1998年的钟声敲响，新的轮回时间出现，所有人都在走向未知的命运。千钧和文良一起到警视厅递交警方特别协助人员的去年总结。高木警官帮着二人处理完那些手续后，笑道，“我今天跟你们介绍个新同事，是我的搭档，千叶警官！”胖胖的千叶警官上前，“你们好！我早就听高木说过，你们曾经多次帮助我们警方破案。”千钧和文良一起回礼，千钧暗道，千叶警官也终于来了，目暮的班底人马都到齐了。
不在场证明，暗号，作案手法，教义，一个充满神秘的黑暗组织，也再次伸出了魔手。柯南跟随毛利和小兰来四菱银行办事，毛利小五郎想要把去年的帐清一下。柯南拿着一本推理书坐在椅子上，猛然抬头看见银行的办事员，竟然是失踪许久的广田雅美。雅美低头看了看手表，似乎有些焦急。柯南疑惑，她怎么到这里来了？随后，柯南用耳环手机通知了千钧，“我找到了广田雅美了，她就在四菱银行上班……”千钧激动万分，“好，她终于出现了，真是的，我马上过去。”千钧对雅美一直有一种亲近感，雅美出狱后不辞而别，让他非常难受。现在，突然有了消息，千钧的心情可想而知。
这时，小兰从后面走过来，“让你久等了，柯南。”柯南问侦探费都存进去了吗？小五郎摇着存折哈哈大笑，“而且还汇入一大笔哦！汇款的数量多得把存折都打满了，哈哈……”柯南惊叹，“太好了！那我们找个地方吃完午饭再回去吧。”小五郎点头，“好吧，我已经好久没有在中午好好大喝一顿了！”小兰立即给兴奋状态的毛利泼了冷水，叉腰怒吼，“我们现在谈得是午饭！”毛利不屑摇头，“我现在得去换一张新的存折了。”柯南汗，“真是受不了这个酒鬼！”
毛利看到戴眼镜的广田雅美，大喜过望，“美人！这位小姐，要麻烦你一下，请你帮我把这本存折，另外换一本新的。”雅美被吓了一跳，这才发现毛利早就不记得自己了，其实也难怪，上次的事情都过去n个月了，小五郎又神经大条，雅美当时委托案件时也是化妆，所以没有认出来。雅美担心被识破，“这位先生，实在抱歉，请你到那里取一张号码牌后，轮到你的号码，再来办理吧。”小五郎有些尴尬，“看来要排队才能办理啊！小姐，请你等我一下，我会马上回来。”说完，小五郎匆忙跑去取号码牌。
雅美低头看表，柯南走过来，“雅美姐姐，你怎么了？”雅美吃了一惊，“原来是柯南啊！”柯南问她为什么从一开始就一直看手表，雅美笑道，“因为现在业务有点忙碌，我想知道还要多久才到中午。”说完雅美站起来，跟柯南说再见，匆忙离去了。柯南疑惑，小兰低声问，“她是谁啊？怎么看起来有些眼熟？柯南，你认识她？”柯南点头，“她是广田雅美小姐，千钧哥哥的红颜知己，小兰姐姐，你忘了吗？我刚才问了其他人员，雅美小姐是最近不久才到这家银行工作的。她平常待人很亲切的。”
小兰想起来了，“原来是她，我记得她曾经委托爸爸找人，那件案子结束入狱6个月后被释放了。”旁边传来小五郎的惊叫声，“不见了！那位美丽的小姐怎么不在了？怎么会这样？”看着小五郎的色狼丑态，柯南和小兰觉得非常尴尬，色字当头居然连自己的委托人都忘记了。小五郎还要排队办手续，柯南随口说要去外面活动一下。小兰叮嘱他在外面要小心车子，柯南答应一声，抱着滑板离去。
柯南走到四菱银行停车场，听到里面传来奇怪声音，紧接着传来一声枪响和玻璃破碎的声音，柯南大惊，急忙跑过去，躲在一辆汽车后观察。原来是有抢匪来抢劫银行的运钞车。歹徒有2人，其中一人手持散弹枪，另外一人好像是手枪，正威胁着运钞人员搬运钞票。另外负责保护运钞车的警务人员倒在地上，不知死活。柯南离得太远，有些地方看不清楚。
柯南拿出侦探徽章，低声呼叫千钧，“快点，这里发生抢劫案了！”千钧正在开车来的路上，文良就坐在旁边。千钧苦笑，“可恶，现在的罪犯都疯了，怎么动不动就去抢银行！”文良急道，“你快点开，我们过去将他们抓住，又是一件大功！”
柯南刚刚放下徽章，身后传来小兰的声音，“柯南，你在这里干什么？”柯南大惊，发现毛利父女站在自己身后，抢匪也听到了声音，脸色大变。毛利以为柯南在恶作剧，“好了，我们回去了。”这时，抢匪突然上车开车逃跑，那名岸井警卫大声呼救，“快帮忙啊，强盗啊！”那辆车飞速驶过，小五郎急忙拉住小兰躲开，“八嘎，这辆车搞什么？”柯南大吼，“他们是抢运钞车的抢匪！小兰姐姐，你快去打电话报警！好像还有人受伤了，快去叫救护车。”说完话，柯南放下滑板追了出去，小兰阻止不及。
毛利立即吩咐小兰通知银行的人，他去看那两个受伤的警卫。抢匪的车飞速奔驰，柯南急追，“可恶，这什么速度啊！我根本追不上，能跟着已经是全力了。千钧，怎么还没有到啊！”千钧很不幸，车被堵在路上了，他和文良气得大吼大叫。随后，抢匪的车不顾火车即将驶来，强行通过平交道，柯南紧跟其后，飞跃环状线，结果失败跌落在地，“可恶，被他们逃掉了。”
目暮警官、高木警官、千叶警官带队很快赶到了被抢现场，警察们开始调查取证。千钧和文良也在平交道附近追上了柯南，可惜，已经失去了抢匪的踪迹。三人无奈，先回银行去跟目暮他们会合。这次被抢的金额高达十亿，是从总行那里要分给分行的钱，全部被抢光了。柯南将抢匪的车号告诉了高木警官，高木马上通知交通课的宫本由美等人立即开始排查。目暮发愁，“抢匪是两名手持枪械的蒙面歹徒啊！”