孙逸仙食言，让陈炯明对此也非常反感，他认为“我们之所以一直闹革命、试图武力颠覆北洋政|府，无非是因为北洋军阀忘掉了《临时约法》、蹂躏了皿煮宪政，现在既然《临时约法》已经恢复了，我们自然也就不必造反了。”
因为北洋政|府几乎同时宣布实施孙逸仙坚持恢复的约法，孙逸仙的护法运动应该宣布成功了。可是孙逸仙仍然不顾陈炯明的反对，坚持要通过军事北伐，暴力推翻北洋政|府，他这是哪一出？为反对而反对吗？连直奉一齐吃掉吗？真有些不自量力！
直系6师8旅共有15万人集中在军事强人吴佩孚手里，奉系连人民军带奉军有23个师三十多万人，都是野战部队，凭粤军的几个师？蚂蚁吃象吗？
历史上若不是直奉之间打了场大仗、吴佩孚又被冯玉祥等人抄了后院，北伐军怎么也打不过他；奉系也是因为郭松龄叛变打得内部天翻地覆死了几员大将而元气大伤，否则历史怎么写还真得有看头。张汉卿已经初步扭转了奉系在历史上的错误，陈炯明便不想犯这个错误了。
而且眼见得人民军势大，福建督军李厚基开始亲皖系后来改投直系，目前被皖系残余藏致平击败，传闻闽督李厚基已向新上任的赣浙闽边防使孙传芳求救。孙传芳是张汉卿委任的官，若是入闽，势必要与其产生龌龊。而且现在直奉系入主北京，这北伐，伐得究竟是谁？
陈炯明一直主张先在广东搞好皿煮宪政，仿照美国，建立与美国相仿的联邦制度，逐步走向和平统一，即“联省自治”。但孙逸仙主张“中|央集权”，要用武力北伐，以便自己夺取政权。两人脆弱的表面和气在他的参谋长邓铿被刺杀后变得不堪一击。
他之前已经与孙逸仙有了龌龊了，那是去年4月非常国会选举孙逸仙为非常大总统的时候。这里，他是反对孙就任大总统的，他甚至不参加孙的就职典礼。
他认为依照总统选举法，总统由两院联席选出，出席议员至少须全部的三分之二，即580人才可以，而广东只有二百多人，还不够原众议员的一半，而且实行记名投票，这不是自毁法律吗？和北方毁法又有什么本质不同？一旦广东成立正式政|府，结局只有一个，南北将再次陷入战争之中。
孙逸仙还是做了，因为非常时期议员的人数不够，便称之为非常国会，他这个非正常国会选出来的总统，自然就是非常大总统了…
不过陈炯明毕竟是实力派，“北伐”还是要靠他的，尽管心里怎么想的不知道，孙逸仙还是任命陈为陆军部长兼总务部长，并说服他加入国民党----这个国民党已经是第四次改组过的，不需要盖手印并向孙逸仙本人宣誓效忠了。
这种纷争在陈炯明部将叶举擅自率领驻桂粤军东返广州、向大元帅府索要军饷、寻衅滋事时开始激化。孙逸仙大怒之下，撤销其粤军总司令、广东省长、内务总长职，只保留了陆军总长，不愿北伐的陈炯明辞职回老家惠州。
见北伐军在赣南节节胜利，进迫赣州，大有与人民军相会南昌之势，孙逸仙于是让胡汉民留守韶关，自己于夏天自桂返粤，他要亲自安顿大后方的局势。
粤军是陈炯明的部队，他虽然撒手，孙逸仙的人却接不动。没办法，孙逸仙委任陈炯明的部下叶举为粤桂边督办以示信任。但叶举并不领情，竟然打着迎陈复职的旗号带着六十多营粤军来到省城。
不过这时候粤军内部已经分化，一派要求陈炯明马上回省，恢复所有职务，镇摄大局；一派则不满陈炯明对孙逸仙过度软弱，希望由叶举领导，与孙彻底决裂。如果陈炯明不同意，就派他出洋（这个时代政治人物下台常见的作法）或继续在惠州休养。
叶举宣布广州戒严，大街通衢，遍布岗哨，意图恐吓----毕竟以孙逸仙的威望，叶举也不敢乱动，能把他逼走就是胜利。此时孙逸仙与夫人宋庆龄驻广州总统府观音山的粤秀楼，叶举在广州城中驻兵数万，他就一个警卫团，可见他应该知道叶举的意图，否则就不至于如此托大。
他在总统府设宴接待粤军将领，竟没有一个高级军官应邀前来，只来了几个中下级军官，这让孙逸仙大为难堪。
他警告粤军几个下级官员说：“告诉你们的长官，不要以为据守白云山，便可胡作非为，我立刻上永丰舰，升火驶入东江射击你们，连你们的根据地也一并铲除！现在东江水涨，永丰炮舰可以直行驶入陈炯明的老巢！”
各界请求陈炯明回省的函电铺天盖地，前往劝驾的使者络绎不绝，都认为只有陈炯明能够收拾得了局面。孙逸仙也一连拍了三封电报，要求陈到广州面商一切，又派人到惠州催驾。
然而陈炯明认为此举有兵谏之嫌，他表示在各省军队撤出广州之前，他都不打算去广州。显然他不想被人误解，他说：“一旦粤军叛孙，则天下之恶皆归焉”，这是他不愿看见的。