护山卫一下子成立了6个千户所，远远超过之前众人设想的最多五个千户所，除了第四千户所和游记千户所尚在外，其他四个千户所的编制人数达到了三千五百人，加上之前要求的第四千户所目标是两千人，游记千户最低一千人，一算下来，护山卫的总人数要达到恐怖的六千五百人了，虽然没有满编满员，但规划已经出来，众人都要朝着这个方向前进了。
众人又听李惠军吩咐：“成立护山军事学堂，我亲自任护山军事学堂山长，王伯元为副山长兼任教俞，所有队以上军官必须进入军事学堂接受教育，具体的讲师由王伯元副山长选拔。
先期培训百户级军官，各百户所建制完成后，百户和副百户交叉培训，每次培训时限为半年，一年后完成所有百户级军官培训，然后是队级军官培训，也是交叉轮训，每次培训期限为三个月，最后是后备队级干部培训，后备队级军官必须识字，这是铁律，不识字不得提拔，每次培训期限为一个月，长期坚持。”。
对军官的培训大家没有异议，都认识到了培训的重要性，这次出征就发现，识字的军官的视野及其开阔，总有意想不到的主意出现在战场上。最后众人又根据战场总结出来的经验，重新制定了大体的训练大纲，有王伯元赞划具体完善。
众人商议了一天的时间，将军制改革大体框架制定完成。
第二天，议事厅会议规模扩大，扩大到所有副千户以上军官，甚至有部分在出战中表现优秀的百户级军官，众人开始商讨武器配置问题。
大家形成一个意见后，会安排一个百户所前来进行实验，甚至让两个百户所对战，其中一个百户所模仿元军冲击，看看有什么不足的地方。
经过四天商议，针对元军的军事特点，众人不断的完善军队的武器配置问题，最终形成以一个步军千户所为一个单位，长矛配合大刀的阵型，弓箭中队采用标枪和弓箭结合的远程打击单位，敌军两百步开外时弓箭覆盖，一百步开外时标枪覆盖，针对元军骑兵喜欢共计侧翼和后方的特点，李惠军要求研发便携式阻拦装备，必须减缓元军骑兵冲击。
经过五天的会议，确定下来了基本的武器配备问题，但有些武器需要重新研发。
李惠军重新建设了教育体系，李家学堂为基本教育单位，所有辖区内的适龄儿童必须入李家学堂接受基本教育，包吃包住，跟之前的改编相同，但学习年制改为三年，仍然由李惠军任山长，杨李氏任副山长兼教俞。
成立格物院，由周正任格物院院长，周旦旦任副院长，所有格物院成员由李家学堂毕业的学生担任。
李家学堂毕业的学生有多处选择，第一是加入格物院，第二是加入护山卫，第三是跟随赵竖仁治理辖区，第四是进入商队，第五是当老师，第六是回家种地。当前的李惠军缺少读书识字的人才，基本没有回家种地的学生。
因为辎重不再单独设立军队，李惠军当场给格物院下达了研发军粮以及便携式随军袋的任务，并将后世羊肠子布袋的理念告诉了周正，还有武器改进的命令也同时下达。
最后一天，李惠军直接任命了政务领导层，如今的李惠军护山系已经实际控制了6个乡的地盘，除了任城县北面，尤其是和衍圣公的土地接壤的地方没有实际控制外，其他地方都纳入了护山系的控制。
李惠军任命赵竖仁为阳沟山治理委员会委员长，王庄乡里正王正强任副委员长，贺文明为治安局局长的领导班子成员，其他乡的里正仍有原里正担任，但为每位里正配备了一个副手，副手全部来自李家学堂毕业的学生，协助里正治理本乡。
在接受了难民中的匠人之后，各种匠人非常多，又新成立了武器作坊，主要生产弓箭、长矛、标枪、大刀等武器，这样李惠军手下就有伊皂作坊、雪花膏作坊、蒸馏作坊、打铁作坊、武器作坊和炊饼作坊。
李惠军将山上的所有作坊统一成了阳沟山商业联盟，李惠军任命陆宝的弟弟陆钢为联盟秘书长，主持所有作坊的生产制造，刚14岁的陆钢成为护山系最年轻的中层管理人员。
李四丁依然任商队主管，赵其山任管事，杨小翠依然是管家，负责管理银钱等所有事情。
最后又定下了所有人的薪俸问题，基本原则是最基层的副队长必须拿到5钱银子，副里正同副队长薪俸，所有里正都将接受护山系的薪俸，让各位里正彻底归心。
普通士兵依然没有薪俸，但每人家里可以减免半成地租，每户最多减免两成，只有从军才能减免地租，一户有四人从军，就可以减免两成，也就是说只要缴纳三成地租即可，在后世，这属于重税，但在当时，这属于轻徭薄赋，毕竟只要缴纳了地租，剩下的元廷的各种税费和徭役都有管理委员会负责，减免以管理委员会的户籍册为准，可以析户，但不能并户。