嘉兴失陷消息传至杭州后，浙江巡抚佟国器便封了全城，除非持有军情公文，验明无误方可入城，否则任何人等一概不许入城。
佟国器手中原掌握两万余绿营兵，还有一支五千多人的水师，这支兵马因长年和浙江沿海的明军作战，堪称精锐。只可惜其中大半兵马却葬送在前年达素组织的攻厦一战，水师更是全军覆没，直接后果便导致郑军大举攻打南京时，浙江方面能派出的援军不过千余人。
马逢知反正归明后大举入浙，为守杭州，佟国器是拆东墙补西墙，从邻近的宁波、台州、温州、金华等地拼凑人马，勉强使杭州守军达到了六千余，不过内中真正能战的还是驻防满州八旗的七百余兵，以及闽浙总督的督抚和他佟国器的抚标，兵力不到两千。而挥师来攻的马逢知部号称十万，实有兵马两万多，一路攻城略地，士气高昂。若不是马逢知贪财大意，中了佟国器的计，只怕杭州城早已换了主人。
马逢知兵败以后，佟国器对那些随马逢知反正的绿营兵将计往不咎，大肆招揽他们，前后收拢了马部万余人。这些人一部分由游击刘承荫带领驻防嘉兴，余下一部分则在杭州城中。
杭州原是一大城，无有内外之分，顺治三年设了满城，便有内（满）外（汉）之分。内城有平海、承乾、拱宸、迎紫四座城门，由驻防杭州的满州正黄旗、正红旗、镶白旗兵驻防。外城则有武林、艮山、望江、望潮、凤山、清波、涌金、庆春八座城门。其中庆春门由汉军旗单独驻守，清波门和涌金门则由汉军和绿营协守，其余五座城门都是由绿营驻防。
加上收拢的马部降军，连同从金华等地调来的防营，杭州城现在纸面上的守军达到了万人，只不过佟国器也好，闽浙总督赵国祚也好，对这些绿旗营并不是信得过。倘若太平军不是这么快就入浙，督抚倒也有信心将绿旗营整编彻底，可太平军却没有给浙江半点喘息之机，马逢知兵败只半个月，太平军就从松江方向打了过来。
五天前，佟国器便昼夜在城门楼上或靠近城门里边的宅院中当值办公，一是为了快速处理军情，二来则是为了震摄马军降卒，有什么风吹草动他也能及时调忠心的兵马弹压住。外城各门也都调了汉军和满州大兵协守，门禁森严得很。城中百姓也被勒令在家，禁止走动，种种举措之下，杭州城中倒也平静，无有先前马逢知兵临城下的乱象。
守城之要务，城防士气为一重，另一重则是军械和粮草。趁太平军还没有打到余杭，佟国器这几天便不断督促邻近府县往杭州紧急调拨粮草，做好了坚守准备。驻防杭州的昂邦章京何魁更是亲自带兵搜刮杭州附近几县，强拉了不少百姓青壮回杭州，为的就是太平军打来之时，城上能有足够的炮灰消耗。对此事，佟国器故作未见，任由何魁荼毒左近。
总督府那边，听闻率军打来的太平军大将是个在广东降过去的满州佐领后，闽浙总督赵国祚就派了幕僚韩可东往海宁欲说动那佐领迟缓进军，要是不行，就借满汉之别挑拨这满州佐领和贼秀才的关系，要是能让贼秀才临阵换将就更好不过了。
韩可东是前日傍晚时分从海宁赶回来的，一入城便急往总督衙门去，稍后总督衙门便来人请佟国器去议事。佟国器到后，赵国祚很高兴的对他说，韩可东幸不辱命，虽那苏纳没有明言，但送去的礼物他都收下了，且秘密派人送韩可东出城。种种迹象表明，那苏纳虽在太平军中位居高职，可毕竟是满州出身，心中对于将来也有担忧，很可能会为自己着想，迟缓来攻杭州。
佟国器听后大喜，建议总督大人是不是再派韩可东去海宁，争取能够说服苏纳再投过来。这个可能性很低，但也不是没有，赵国祚考虑片刻，认为不必着急此事，待看看太平军的动向再说不迟。韩可东也道，那苏纳一旦真的迟缓进军，南京的贼秀才定然会生疑，届时己方派些细作在江南散播苏纳本为满人，和汉人非同种，其心必异等流言，假以时日，怕能收奇效。现在就着急劝他反投，只怕有些心急。
佟国器细思也对，心急吃不了热豆腐，眼下能说服那苏纳迟缓向杭州进军已是天大好事，哪还能奢求对方就此再归大清呢。
从总督府回来后，佟国器还是有些不放心，特意派了几拨探马往海宁、余杭方向剌探太平军是否真的停滞不进，同时派人在各府散播太平军在江南大搞清欠之事，以求能激起浙江士绅对太平军的反抗，使清军得到更多的助力，也让太平军在浙江无法立足。
这日，武林门外来了一队满州骑兵，为首那个满州参领朝城上呼喊道：“快放下吊桥，我们是福州过来的！”喊完，便将手中加盖了火漆的公文朝城上摇晃。