大傻谷的标牌路口处,小智一行人到达了大傻谷这个地界,这里是以大溪谷景色而闻名全世界的地方。小智看到不远处的一大群人，依次背着装备向着大傻谷的内部走去。小智有些不解的问道“前面的那些人,背着锄头是要干什么？”
“前几天网上疯传,说是这个地方发现了已经绝种的神奇宝贝的化石。我想这里是兴起了寻找神奇宝贝化石的热潮了。”小茂回想了一下,自己之前在网上找最新的论文时。似乎是有看到大傻谷的情报。联合了一下上辈子的经历,很快的猜出了这里正在发生着什么。
“神奇宝贝的化石？那我们也去挖掘吧,小茂。”小智眼睛亮了起来。绝种了的神奇宝贝的化石啊,很难得到东西啊。
“可是我觉得这么做的话，不就等于是故意去吵醒那些变成化石,而沉睡在地底的古代神奇宝贝呀。”小刚不赞同的说道。小茂作为研究员,为了破解神奇宝贝的秘密而进行合理的挖掘，算的上是迫不得已的行为。可像是对面的那些人，为了一己私欲而进行挖掘神奇宝贝的化石。是对神奇宝贝它们的不尊重吧？
“小刚说的很对，小智我们不该去打扰它们。现在的这个世界，已经没有适合它们生存的环境了。”小茂开口劝道。他知道小智将小精灵的意愿放到第一位，所以不担心小智会因为想要得到古代神奇宝贝的化石而一意孤行。倒是他比较在意，他记得，当年他来大傻谷跟着那帮人一起挖神奇宝贝化石的时候。火箭队那帮家伙似乎来过。
因为时间略有些久远，小茂也记不太清，火箭队到底有没有来。不过，这件事闹的这么大，依照火箭队那群人的品性，是会来捣乱的吧？
小智虽然觉得好可惜，却还是听小茂的话，不去打扰那些已经沉睡了的神奇宝贝。小霞自然也是觉得可惜的，这是多么难遇的机会，不过小茂说的也对。小霞也只能摒除心中的那一丝遗憾，开口问道“可是，那些人该怎么办？”
“君莎小姐应该会来维持秩序，这里也没我们什么事，还是快点赶路吧。”小茂想了一下，就凭借火箭队三人的智商，有君莎小姐在，完全可以震慑住。没他们什么事，还是早点离开这里比较好。
小智和小刚还有小霞相互看了眼，大傻谷除了景色之外，确实没什么值得逗留的地方。便点头同意了。
四人带着三只小精灵快速离开，而他们并没有发现。在他们不远处的石块后，拿着白板笔的胖丁在看到四人停留时便努力爬上石头。但当它爬上去，准备开唱时。本该站在不远处的小智一行人已经没了踪影！胖丁很生气，自己费了那么半天力气爬上石头，结果本该听它唱歌的人却不在了。胖丁气鼓鼓着脸，一副不开心的表情。
小智三人跟在小茂身后，在看到大傻谷内的景象时，小智不有感叹道“没想到，居然来了这么多的人啊。”
“神奇宝贝化石也是很稀少的物品。在大木博士那里都没有见到过神奇宝贝的化石。它的珍贵性，小智你这种不懂用大脑思考的热血训练家是不会懂得。”小茂看了眼那些挥汗挖掘的人，曾经的自己还是其中的一员呢。年少轻狂的自己，首次挖掘出来的化石居然是…神奇宝贝的大便化石。现在想想，那时的自己还真够天真的。以为随便挖挖就能挖出神奇宝贝化石来。
“这么多人都在挖，却没有挖出来，会不会是这里有神奇宝贝化石的传闻有问题？”小刚看着远处辛苦的人们，至今都没看到那个人挖出什么化石来。这个消息的来源到底可不可靠？
小茂微皱眉，这个问题还真不好回答。真思考怎么说呢，却听到不远处的山路上传来了熟悉的声音。
“不知道他们顺不顺利？”小智他们顺着声音看去，只见喵喵背对着他们，站在前面的山路上，似乎看着什么的继续道“以他们过去的记录来看，不知道可不可以依靠啊。”就在喵喵担心武藏和小次郎能不能顺利的完成任务时，武藏和小次郎突然窜了出来，说着那每天必须说一遍的开场白。
小茂无奈的摇了摇头，小智嘴角抽搐的无奈道“原来在自己人面前也要说一遍吗？”
“火箭队他们还真是敬业啊。”小霞的嘴角也抽搐着。话都被小智和小霞说了，小刚只能点了点头表示，自己的赞同。
皮卡丘脑门挂了个大大的汗珠子，显然对火箭队的开场白表示了无奈。伊布撇头看向一边，看那帮人犯傻很伤眼。利欧路看着山壁思考，要不要提醒老师让迷你龙出来将火箭队他们送走。
好在喵喵在小智他们听的有些不耐烦时，打断了武藏和小次郎的开场白。并大声地询问道“说那么多废话一点用都没有，你们到底装好炸弹了没有？”
被打的武藏很生气，一拳将喵喵打飞，大声喊道“你在干什么啊！”在看到喵喵被碎石压倒在地时，武藏这才回答了喵喵的问题“炸弹我们当然装好了。”
“就是呀，只要炸掉这一代的岩盘的话。隐藏的神奇宝贝化石，一定就可以找得到了。”小次郎自信满满的说着他们这次的打算。
喵喵从小石堆里爬出来，大吼道“你们把我埋成化石干什么！”
小霞听到火箭队他们的话后，立马明白他们是准备炸掉大傻谷。立马提醒小智他们，小茂皱眉的想了一下上辈子这段事，但因为记忆太过久远。小茂也不记得火箭队到底成没成功炸掉大傻谷。不过目前炸药已经埋好了，他们碰上了自然不能不管。跟小智他们说了一下，大傻谷炸掉之后，在大傻谷挖掘的人可能会出现危险。小智当机立断的让小刚和小霞去通知其他人。本来还打算让小茂去的，只是小茂直接说了句“我跟你去阻止火箭队。”
小智本想说自己一个人去就可以了，但小霞和小刚却是劝道“有小茂跟着，我们更放心一些。”“就是说啊，小智你自己去的话，万一火箭队的人又耍诈该怎么办？”
因为没太多时间来为这种事情吵下去，喵喵已经为导火线点火了。小智和小茂赶紧跑了过去，只是当他们过去时，对方已经点完了火。
火箭队见到小智和小茂，很是郁闷。他们都不去找小智他们的麻烦了，结果小指他们居然倒找他们的麻烦。最让他们气愤的是，什么事只要碰到小智他们，一定都会变成好讨厌的感觉！
小智在看到导火线被点燃后，立马叫出了杰尼龟，让杰尼龟浇灭导火线上面的火。杰尼龟立马向着导火线喷水。只是，导火线正在燃烧，杰尼龟总是慢上一拍。就在这一下一下的失败中，导火线很快烧到了下一块路上。杰尼龟赶快追上。
小智和小茂带着皮卡丘和伊布还有利欧路赶紧追了过去。身后，武藏和小次郎看着小智他们追了过去。立马放出了阿伯怪和双弹瓦斯。
就这样，杰尼龟和小智他们追着导火线，火箭队他们追着小智他们，一起往着峡谷下面跑去。
小次郎看这样下去也不是个办法，立马对双弹瓦斯下令，准备让双弹瓦斯用泥浆攻击小智他们。只是，他这一分心说话，没注意到路况的问题，脚下一绊，身形一倒。直接就撞在了武藏身上。武藏瞪大了眼，来不及反应，直接就扑到了阿伯怪的身上。阿伯怪被压，尾巴一抬，双弹瓦斯和喵喵齐齐中枪。
当小智正在愁，导火线烧得太快，他们这样追下去不是办法的时候。突然听到身后有声响，和小茂一起转过头时，皆是一惊。火箭队他们居然形成球状想着他们滚了过来！要知道这可是下坡路，火箭队他们这样滚下来，根本就让他们无路可躲。
结果自然就是，小智和小茂以及无法被幸免于难的，皮卡丘、伊布还有利欧路，全部成了这个球体的一部分。飞快的向着大傻谷的谷底，沿着山里开始往下冲去。
在经过一阵头晕目眩，外带身体被各种摔后，小智他们这群人终于在导火线烧到之前，来到了谷底。只是脑袋晕眩的众人此刻的反应有些迟缓。
小茂和小智被压在最下面，而导火线就这么在两人前面缓缓烧过。两人抬头一看，在一个山洞口，放着三捆刺眼的，红彤彤的刺眼的炸药。小茂已经来不及感叹火箭队哪里来的钱搞来的炸药。和小智一起急忙的想要起来去阻止炸药的爆炸。皮卡丘它们也费力的想要爬出来。只是身上的火箭队那些人，比小智他们动的还要厉害，他们只是想要古代的神奇宝贝化石，可不是准备自己成为尸骨陪着那群化石啊。
眼看炸药就要爆炸了，火箭队他们挣扎的更厉害了。这让呆在下面的小茂和小智完全挣扎不出来。倒是皮卡丘因为身子较为小巧，被他们这群人胡乱的挣扎了一下，竟是出去了。只是，这个时候导火线已经要点燃炸药了。被挤出去的皮卡丘，急忙的看了眼小智他们，然后小智他们此刻已经慌作一团了。没人理皮卡丘，皮卡丘一慌，竟是直接使出了电击！
小茂在看到金色的光芒划过今后，急忙喊道“住手啊，皮卡丘！”不能用电引爆炸药啊！只是小茂的话还是晚了点，皮卡丘的电击几乎是与导火线一起引爆了炸药。
当炸药被电后，解不开的叠罗汉瞬间安静了。小智和小茂他们不挣扎了，火箭队也不动弹了。皮卡丘已经全身僵硬了。伴随着一声意料之内的爆炸声，火箭队和小智他们，掉入裂开的地面里。而此刻，本是纠缠在一起的他们，也分开了。
见分开了，小茂急忙丢出暴鲤龙的绿色宝贝球，大声道“暴鲤龙，接住我们！”
红色的光芒闪过，暴鲤龙身形一摆上半身接住了小智和小茂，腰部接住了皮卡丘和伊布。尾巴上挂着火箭队他们。
小茂松了口气，这裂缝也不知道有多深，这要是直接摔下去，能不能活着都是个问题。小茂拍了拍暴鲤龙，示意它降落。
暴鲤龙缓缓降落，在快到地面上时，快速把尾巴上的那几个甩到一旁，随后让皮卡丘他们从自己身上下来。小茂道了句谢，便将暴鲤龙收回到宝贝球。将宝贝球挂回腰间，小茂开口道“皮卡丘，麻烦你用一下电击，不用太多的伏特，只要能稍微照亮一下四周就好。
皮卡丘向着自己身前的空地使用了十伏特的微弱电击。微小的光芒照亮了四周。但也只能看个模糊的形态，自己手上又没什么可以照明的小精灵。照明？小茂突然响起了小智的火恐龙，虽说还不听话，但自己现在只需要他尾巴上的火焰所带来的光亮。想到这里，小茂开口道“小智，你把火恐龙叫出来。”
“叫他出来？”小智虽然不解小茂叫火恐龙这个不听话的小精灵做什么，却也只是疑惑了一声便放出了火恐龙。
火恐龙出现的瞬间，小茂和小智只觉得眼前一亮。小智想去和火恐龙套套近乎，只是被小茂抓着死死的，便郁闷的看着火恐龙。火恐龙被小智那哀怨眼神看的直郁闷，直接向着小智喷了一口火。
小茂拽着小智躲开了，皮卡丘直接一个十万伏特劈了过去。火恐龙转头便向着皮卡丘喷火，皮卡丘也不客气，直接最大力度十万伏特劈过去。正中骄傲过度的火恐龙。火恐龙成功倒地不起。
小智去吧火恐龙抬到一边石台上躺着，小茂借着火恐龙尾巴上的火焰，发现利欧路和小智的杰尼龟不见了。当时记得这两个似乎略靠边。应该是没有跟着他们一起掉下来吧？小茂看了眼上面，发现上面黑不溜秋的。想必因为炸弹扎里导致滑坡了吧？杰尼龟和利欧路在上面的话，应该会叫来人。
事实上，正如小茂猜测的那样，利欧路在告诉了赶过来的小刚和小霞，小智和小茂他们掉到下面时，小刚他们便急忙想要挖出一个口来，好看看小智他们现在的情况。
利欧路挖了一会儿，就感觉到一个喜悦的情绪波动。向着波动源看了过去，在看到胖丁时，有些头疼的皱了下眉。只是，身后传来了塌陷声，胖丁身上传来了生气的情绪波动，让利欧路暂时放弃了去抢夺白板笔的想法。
地下洞窟内，小茂坐在地上。小智去戳火恐龙，小声的抱怨着什么。不远处火箭队因为爆炸的波及，再加上暴鲤龙接住他们的时候可没那么温柔。直接昏了过去。
没过多久，火箭队的人便清醒了。喵喵理智的分析出，他们是因为炸弹在这个地下洞窟上开了个打洞，从而掉落下来的。随后，武藏和小次郎便指责小茂和小智。如果不是他们来捣乱，他们怎么可能掉到这个阴森森的地下洞窟内？
小智被人这么挑衅，怎么会忍耐呢？再者说，本就是这帮家伙不该在大傻谷放炸药这种危险物品。
喵喵简直要被气死了，他们现在掉在这个不知道离地面有多深的地下洞窟内，这几个人居然还有心思吵架！“你们都别吵了，我们目前所要想的是，怎么样离开这个洞窟！”
“喵喵说的对，你们再怎么吵，也不可能从这个洞窟内吵出去。”小茂略有些意外的看向喵喵，看来喵喵它，总能很直接的看到事情的中心呢。
小次郎在一旁笑的自信，武藏本来以为小次郎有出去的办法。结果小次郎告诉她“没指望了。”气的武藏直接给了小次郎一拳头。没指望了你笑的那么自信作甚。
“小茂，你有出去的办法吗？”小智看向小茂，小茂有暴鲤龙应该有出去的办法吧？
“恩，出去倒是可以出去。但怎么处理上面那些石头？”小茂较为为难的看着头顶，如果强行突破的话，一定会比石头砸伤的。
就在这个时候，伊布和皮卡丘低声叫了出来，皮卡丘的声音略带了些恐慌，伊布的声音内，满是警告。
火箭队直接吓成一团，小茂站了起来看着远处阴暗的角落，手放在了迷你龙和叶皇蛇的精灵球上。当躲藏在暗处的小精灵从阴暗的角落里走出来时，小茂大吃一惊。那些居然都是已经绝种了的神奇宝贝。
因为吃惊和惊喜，小茂率先做出了符合研究员身份的事。立马不顾自身危险的拿出了电脑，开机，调到摄像，然后将摄像头对准那些小精灵。
小智本想拿图鉴的，但看到小茂这一串可以说是超越人类速度的反应后，疑惑的问道“小茂，你这是？”
“他们是，镰刀盔①，菊石兽②，多刺菊石兽③，和化石盔④。是几万年前已经绝种了的神奇宝贝。原来还活着！”小茂的语气少有的透着吃惊。虽然在过去他见过一些活着的已绝种的神奇宝贝。但有一些是根据化石上的基因而孕育出的神奇宝贝，还有的则是不知道从哪里生活而冒出的神奇宝贝。它们的一切都是迷雾重重。有人认为他们还活着，但是却无法证实。小茂的眼底有些兴奋，大傻谷的地下洞窟居然有活着的古代神奇宝贝。是活着的，不是人类有现代的科学技术来孕育出来的。而是真真正正的古代神奇宝贝。
武藏和小次郎也在一旁开心的表示“太好了，我们可以成为幸存的古代神奇宝贝的发现者，而名留青史了。”
“要留名青史也应该是作为研究员的小茂才对。”小智大声的反驳道。
火箭队表示，小茂作为研究员确实可以和他们一样名留青史。小智对于火箭队那帮家伙，一副便宜你了的语气，冷哼一声不做评价。指着远处很不友好看着他们的镰刀盔们道“既然你这么想成为发现者，那就请去让他们友好的对待我们。”
火箭队转头仔细了一下，发现这些神奇宝贝们，眼睛发红，像是没睡好的样子。不由做出了一个大胆的假设‘这些小精灵会不会是，并没有变成化石，只是睡着而已？’
“很有可能是这样，也许，这些小精灵并没有从历史上消失。只是因为没有可以适应的生存环境下而选择了沉睡！”小茂的语气内压抑着激动。他知道，如果情绪波动太大，会引发这些被吵醒的小精灵的敌视。虽说小精灵们似乎因为被吵醒而对他们产生了敌视。
火箭队在这个时候居然还敢将精灵球丢向被吵醒，起床气很大的镰刀盔。镰刀盔只是简单的用他那带着锋利镰刀的爪子格挡了两下，就将精灵球巧妙的弹了回去。
因为精灵球的攻击，几只被吵醒的小精灵更加的愤怒了。从阴影处彻底的走了过来。火箭队被吓的往后退了两步，而小茂却是不退，反而往前走了一步。小智急忙抓住小茂的胳膊，轻喊道“你不要命了。那几只小精灵可是有肉食性的在哦。”
“真难得啊，小智，你这是在担心我吗？放心，野生的小精灵的戒备心很强。在不清楚我的实力之前，他们不会轻举妄动的。”小茂的心情很好，不单单是因为发现了活着的古代神奇宝贝。还有这小智难得的主动关心。
“谁关心你了，我只是怕你出了事，导致暴鲤龙不肯载我们出去。”小智最看不惯小茂那副得意洋洋的姿态。嘴硬的反驳道。
小茂心情好，也不点破小智的那点小心思。就在小茂和小智谈话期间，火恐龙醒了过来，不过却没有过来帮忙的意思，打了个哈欠，无聊的看着这边的动静。
小茂它们对面的小精灵们终于按捺不住了，镰刀盔一声令下，向着小智他们这边冲了过来。小茂急忙起身后退，火箭队率先跑了起来，小智和小茂断后。小茂还想录一些近的，可以证明这个是真正的古代神奇宝贝的视频。但太近的距离，很可能让镰刀盔一刀把电脑劈坏。小茂也只能郁闷的小心保护着电脑，顺便偷录两下。
洞窟内，小智他们在上演生死追逐，洞窟上，小霞和小刚正在向君莎小姐解释事情经过。并且请求支援。
小智他们觉得一直这样跑下去不是办法，纷纷让皮卡丘、伊布还有双弹瓦斯和阿伯怪去跟那些小精灵决斗。
皮卡丘的电击没有效果，伊布的影子球也没什么太大的效果。阿伯怪被菊石兽它们缠在了柱子上下不来。双弹瓦斯疑似被当成球来玩了。
就在小智以为他们就要命挂在这里时。镰刀盔他们突然急急匆匆的走掉了。火箭队他们不由欢呼起来，小茂却是皱起了眉，那些家伙是在害怕？能让它们都害怕的神奇宝贝…小茂有种不祥的预感。
当灰紫色的身影将休闲看戏的火恐龙刮倒再地时，小茂除了叹气，也只能叹气了。怪不得镰刀盔他们要逃走，出来的这只小精灵居然是，古代神奇宝贝中最为凶狠的化石翼龙⑤。
“小茂，这……”小智看向小茂。小茂叹了口气，无奈的说道“我们或许有麻烦了，化石翼龙，肉食性的神奇宝贝。也是比之前那些小精灵要强上许多的存在。”
“它想要把我们吃掉啊！”喵喵作为小精灵，自然读懂了在哪里悠闲宣告着自己领土的化石翼龙的意思。
在听到喵喵的话后，所有人都及时的转身开跑。而化石翼龙也展开双翼开始追着众人。就像是悠闲的在玩着猫捉老鼠的游戏。
火恐龙被人轻易的撂倒了，起来的时候有些迷糊，整个龙都不好的居然摆起了POSS。小智看着火恐龙的POSS以为火恐龙打算帮忙。却没想到火恐龙连点反应意识都没有的被化石翼龙再次撞飞。
撞飞撞到石头上，火恐龙总算清醒了许多。此刻洞窟上方的石头松了起来，小智一时放松警惕，居然被化石翼龙抓了起来。
此刻因为那片石块开始塌方，所有挖掘的人都开始撤离。而这个时候，化石翼龙也抓着小智准备飞出去。
皮卡丘和火恐龙快速的抓住了化石翼龙的尾巴，小茂见上面已经松动，直接叫出了暴鲤龙，和伊布快速爬上暴鲤龙的身上，并让暴鲤龙追上去。
当化石翼龙飞出时，火恐龙和皮卡丘被甩到了小刚他们面前。而化石翼龙则是带着自己的食物降落在高处，代表着它身为古代高级神奇宝贝的地位。
化石翼龙看着自己的食物，虽说小了一点，不过勉强填饱一下肚子也是可以的。这样想着，便大张嘴，意图去咬小智。小茂跟着暴鲤龙出来就看到这么一副场景。周围温度微降，小茂声音略寒的对着暴鲤龙下令道“对着化石翼龙使用高压水泵。”
快速带着伊布跳下暴鲤龙的背部，暴鲤龙因为没有了负担，向着化石翼龙便喷射了高压水泵。化石翼龙抓着小智堪堪躲避开暴鲤龙的攻击。
火恐龙看着小智被化石翼龙像是携带道具一样的在空中乱飞。眼底的愤怒越发明显。小智是它的训练家，能欺负小智的也只能是它，换句话说，小智是它的所有物，现在却被其他龙霸占。不爽，深深的不爽，再加上这家伙连着两次把它撞飞，火恐龙的愤怒越来越浓了。
火恐龙开始向着化石翼龙挑战，而化石翼龙对于火恐龙的挑战不屑一顾。甚至对火恐龙做着鬼脸。
火恐龙一怒之下，竟是进化了！在场的所有人都没有想到，火恐龙竟然是在一怒之下，进化成了喷火龙！
喷火龙仰天便是向着化石翼龙喷了一口火焰。化石翼龙看了看脚上的东西，又看了看喷火龙，最后竟然和喷火龙在天上进行了飞行大赛。
小茂担心小智有危险，喷火龙现在的目标只有化石翼龙，虽然确信火恐龙没打算离开小智，就说明对小智还是有着情分在的。但喷火龙那暴躁的性子，小茂实在是放心不下这些冒失鬼。让暴鲤龙载着自己，小茂便也追了上去。
空中三条龙飞舞的场景，让所有人都不由自主的去抬头注目。而在这个时候胖丁站在了扩音器旁，小霞见到胖丁，突然想到，如果化石翼龙听到胖丁的歌，睡着了，小茂不就没有危险了吗！这样想着，小霞跟胖丁许诺，如果帮助他们的话，他们就尽力去听胖丁唱歌。
胖丁自然是满意的，就这样胖丁在灯光下开始大声的唱歌了。
小智见到喷火龙追上来，正感动着，喷火龙因为想要救自己而进化的。然而还没感动完，喷火龙一口火柱让小智彻底心碎了。原来不是为了救我，是单纯的想要找化石翼龙决斗啊！
小茂看到喷火龙的火柱，就知道自己要是不跟过来，小智这家伙就算侥幸被救下来，也要被烤个三分熟了。让暴鲤龙跟上去，在喷火龙喷火柱的时候，放高压水泵浇灭，顺便打化石翼龙。
小刚见到小茂跟上去了，这才有些放心的说道“还好还好，暴鲤龙的水把喷火龙的火浇灭了。要不小智就要被烤熟了，全熟的牛肉可不好吃。”
伊布在听到小刚在说什么时，嘴角抽了两下，果然是物以类聚吗！小智身边的剧集的伙伴，就没有几个正常的。
暴鲤龙的高压水泵准确的打中了化石翼龙的脚腕，化石翼龙下意识的松开了脚，暴鲤龙加速飞了过去，小茂伸手，一把抓住了小智的手腕将至拖到暴鲤龙身上，随后让暴鲤龙回到小刚那边。
喷火龙见小智不在化石翼龙手上了，便加速追了过去，火焰也不所有保留了，高温的火焰冲着化石翼龙喷去。
化石翼龙躲开，失去食物的恼火，让化石翼龙转身便要跟喷火龙打一场。只是这个时候，胖丁的歌声已经在大傻谷回荡起来。
无法抗拒歌声中的催眠之意的化石翼龙渐渐支撑不住的一头栽了下去，刚好栽回到洞窟里。喷火龙勉勉强强的扇动了两下翅膀，寻找着降落点。