次年，高宗下令对高句丽发动大规模进攻，发三十五万大军，水陆分道并进。苏定方在坝江击败高句丽军，屡战屡胜，进围平壤。
契苾何力于鸭绿水大败盖苏文之子男生，斩三万人。时百济旧将叛乱，而苏定方围平壤久攻不下，逢大雪天寒，高宗遂于公元662年二月命唐军自高句丽班师。
退军时，左骁卫将军、沃沮道总管庞孝泰在蛇水战败，庞孝泰战死。这是高句丽灭亡前的最后一次胜迹。
由于渊盖苏文在世期间一直未能采取明智的外交策略，导致唐朝与新罗联合必欲灭高句丽而后快。盖苏文在世时虽然尚能以高压控制高句丽政局，但高句丽内部已经危机四伏，当他死去时，高句丽就已经离覆亡不远了。
公元666年，在泉盖苏文死后，世子男生代为莫离支，但为二弟男建所逼，降于唐，造成高句丽内乱。高宗见状派契毖何力、庞同善等击高句丽，援救泉男生。
不久，高宗以李绩为辽东道行军大总管，统帅诸军，分道合击高句丽。以后一年多时间，各战场捷报频传。
李绩攻取高丽军事重镇新城，并趁势将附近的16座城池全部攻下。薛仁贵在金山击破高句丽大军，斩首5万余级，攻下南苏、木底、苍岩三城，与泉男生军会师。李绩等攻占扶余城，斩俘万余人，扶余川中40余城亦望风归降，再战薛贺水斩俘3万余人，乘胜攻占大行城。到了公元668年春夏，各路唐军会师，推进至鸭绿江。高句丽发兵抵抗，唐军奋勇出击，大败高句丽军，追奔200余里，攻拔辱夷城，高句丽其他各城守军或逃或降。唐军进至平壤城下，围平壤月余，高句丽王高藏派泉男产率首领98人出降。泉男建仍然闭门拒守，并多次遣兵出战，皆败。
到了九月十二日，高句丽僧信诚打开城门，唐军冲进城中，俘男建，高句丽全部平定。唐平高句丽后，分其境为九都督府，四十二州，一百县，并于平壤设安东都护府以统之，任命右威卫大将军薛仁贵为检校安东都护，领兵二万镇守其地。
高句丽第27代国王宝藏王高藏被唐朝俘虏，根据司马光《资治通鉴》的记载，高句丽贵族及大部分富户与数十万百姓被迁入中原各地，融入中国各民族中。另有部分留在辽东，成为渤海国的臣民，而其余小部分融入突厥及新罗。自此，高句丽国家不再存于世。
既然这个疯狂的国家注定是要灭亡的，杜睿当然不介意这个灭亡的时间提前一点儿。
“既然高句丽遣使，便命其进来！”
冯照闻言一怔，当即明白了杜睿的意思，杜睿没说请，而说了一个命字，很显然是没把高句丽放在眼里。
这个时候的中原人，对高句丽都是痛恨有加，隋炀帝三征高句丽，战死者无数，几乎使得中原家家带孝，户户发丧，这对一向骄傲惯了的炎黄苗裔来说，简直就是奇耻大辱。
那个高句丽的使者被带了进来，一身汉家衣冠，见杜睿居然高坐，丝毫没有下来迎接的意思，心中颇为恼怒。
杜睿冷冷的打量着这个高句丽的使者，道：“你是何人，见了本帅，因何不拜！”
高句丽使者闻言，不禁大怒，但人在屋檐下，不得不低头，咬着牙对杜睿拱了拱手，刚要说话，突然身后的冯照推了他一把，使者站立不稳，踉跄着跪倒在地。
众人见状，皆是大笑不止，杜睿看着使者狼狈的模样，也是一笑，道：“不必多礼，起来！”
那个使者知道自家被人阴了，面色一阵红，一阵白的，咬着牙道：“我乃大高句丽莫离支派来的使者，你们这些唐人居然敢羞辱我！”
杜睿冷哼一声道：“你既然奉命出使，自然该晓得规矩，这里是大唐的国土，本帅受皇命，为定襄道行军大总管，代表的便是大唐皇帝，你见了本帅自该下拜！说！有什么事？本帅没时间浪费在你这个小国使臣的身上！”
使者气的几乎咬碎了满口钢牙，不过想起了这次的使命，也只好强忍着怒气，道：“莫离支大人命我前来，就是为了讨要契丹族长阿迦罗奉献给我大高句丽的辽东土地！”
“什么？”
“放肆！”
“高句丽人无耻！”
众将闻言，纷纷跳了起来，有的甚至都将手按在了刀柄上，就等着杜睿一声令下，便将其立斩当场。
杜睿冷笑着摆了摆手，随即起身走到了那个使臣的面前，道：“辽东自古变为我华夏所有，何时又归属于你高句丽了！况且契丹盘踞此处，如今被本帅歼灭，辽东复归大唐，你高句丽也敢来搅扰！”
那时辰被杜睿的气势所压，却也不肯就此干休，从怀中取出了一张羊皮，得意道：“将军还是请先看看这个，这是契丹族长阿迦罗亲自写给莫离支大人的信，宣称愿将辽东一代献于我高句丽高藏王，如何不是我高句丽的领土，还请将军即刻率军退出我高句丽的领土，不日莫离支大人就要亲自率领大军前来接收，莫要发生了误会，有损两国邦交！”
杜睿还没说话，一旁先恼起了秦束，上前一脚就把使者踹倒在地，厉声道：“你这小小偏远蛮夷，也敢来撩拨大唐的虎须，莫不是瞎了你的狗眼，契丹的百万大军都被我大唐诛灭殆尽，如今你却来讨要辽东，好！辽东不给，本将军这里倒是有钢刀一把，你要是不要！”
使者被秦束吓得浑身战战，看着杜睿大声道：“我乃大高句丽的使臣，你们居然敢殴打与我，难道就不怕挑起两国的战端吗？”
杜睿冷笑一声，看着秦束埋怨道：“秦束！你也太放肆了，他口粗狂言，对大唐无礼，是他没有教养，你怎能和他一样，还不快快退下！”
秦束忍着笑，退到了一旁，杜睿接着对那个使者道：“回去告诉你家莫离支，就是那个泉盖苏文，辽东是我大唐的领土，不单单是辽东，乐浪，玄菟两郡也是我华夏旧土，本帅给他一月的时间，乖乖交还两郡，不然的话，本帅便统领天兵亲自去取！来人！送使者出去！”
杜睿说着对冯照使了个眼色，冯照会意，上前一把抓住了使者的胳膊，将其拖出了大帐，没有直接赶出大营，而是望那个堆积契丹人尸体的大坑走了一圈。
看着那尸山血海，高句丽使者的魂都险些飞脱，刚刚离了大营，便飞也似的逃了。
大帐之中，众家将军尚自怒气不息，纷纷叫嚷着让杜睿下令，出兵高句丽。
杜睿也不是不想顺手将高句丽也给解决了，只是没有太宗的旨意，杜睿也不敢擅专，更何况高句丽可不像契丹，那些坚固的城池，要是没有火器的话，可不容易攻陷。
“大军暂时驻扎在此地，苏麟立刻起草奏章，送往长安，将此事据实以报！”