明代全国有超过一千个驿站，其中四川最多，水陆驿站一共199个。如何整顿驿站成了朱由校当前面临的一大难题。
如今的驿站，实际上很多私人都在使用。并非是什么军务、政务才能快马传递，很多商人也在用驿站进行信息的传递，八百里加急同样也服务于商人，毕竟商人有钱，贿赂一下驿卒就行了。
就在朱由校考虑着如何整顿驿站的时候，熊延弼已经进京了。
朱由校连忙召见了熊延弼，熊延弼参见过后，对朱由校问道：“不知陛下召微见臣所为何事？”
熊延弼在皇帝面前淡定得很，反正无官一声轻。
“熊爱卿，朕此次召见，是想请你代朕巡视九边，整顿一番九边军纪。熊爱卿以为如何？”朱由校对熊延弼问道。
“陛下圣明，九边军纪驰废，武将欺压军户，若再不整顿，九边难以安宁。”熊延弼神色顿时振奋了起来，没有了之前那种应付的态度，十分爽快的说道：“微臣愿为陛下巡视九边。”
“好，熊爱卿愿意替朕巡视九边，朕是最为放心的。”朱由校高兴的说道，一边向熊延弼表露一些信任，试图进一步笼络。熊延弼微微一躬，拱手道：“多谢陛下。”
“这样，熊爱卿此去巡视九边，定然会遇到许多被欺压的军户，这些军户生计无着，肯定是需要朝廷接济，朕给你100万两，你视情况接济九边军民。另外爱卿手持尚方宝剑，朕再派两千京营任你调用，爱卿若发现武将欺压军户、克扣军饷，皆可先斩后奏。”朱由校对熊延弼说道。
熊延弼听了愣了片刻，没想到皇帝竟然给了这么强力的支持，看来是真的决心整顿边军了。
“陛下英明。”熊延弼称赞道，他尽管嘴巴臭，但是对皇帝却是不敢放肆，同时皇帝也不是那种什么都不懂的草包。
“再有一个，朕决定从九边抽调兵力前来京城轮训，从而逐步将所有边军编制成京营，再派往戍边，爱卿以为如何？”朱由校问道。
“陛下，您整顿了京营之后，京营风气确实焕然一新，可是九边军户尽管需要朝廷军饷，然而更多却是自给自足。若是全部变成京营编制，恐怕这军费就是海里去了。要知道边军可是有八十多万。”熊延弼连忙劝道，如果把八十多万边军搞成京营编制，那军费需求确实太惊人了。
“也不是一次性都编练成京营，而且八十多万边军定然也存在一些老弱病残已经空额，最后能编个五十万已经最多了。虽然所需军费颇多，不过第一批先编练十万还是没问题的。”朱由校说道，他这个计划已经想出来很久了。
把边军分批抽调到京城整训，把军官全部换成讲武堂培训出来的，讲武堂培养出来的军官全是汉皇党成员，是经过政教部思想教育的，忠诚度没有问题。就算是个别一两个洗脑不太彻底，但只要其他忠诚度高的军官存在，就会形成一种‘势’。
编练出一批，就调回九边驻守，然后编练第二批，只需要几轮过后，九边的边军就全部变成京营编制了，进而校可以轻松指挥。同时还可以杜绝克扣军饷的问题，边军编练成京营之后，军饷都是直接打入他们的银行账户，不过武将之手。