朱元璋借助的本身就是明教，而明教又称为摩尼教，是波斯人摩尼所创立。摩尼教是一个很复杂的宗教，它杂糅了祆教、基督教、佛教。朱元璋上位之后，对明教都采取了清剿。
更是彻底禁止基督教在大明帝国境内传教,禁止三夷教在大明传教。之后的基督教在整个大明帝国初期中期完全没有了立足之地,传教士基本绝迹。
直到，1583年9月传教士利玛窦与传教士罗明坚进入大明帝国，在广东肇庆建立了第一个传教驻地，利玛窦出版了第一份中文世界地图，并用中文和传教士罗明坚起草了第一部《祖传天主十诫》。经过了几次尝试，利玛窦和罗明坚没能建立起新的驻地。罗明坚被教皇召回罗马安排教皇使节去见中国皇帝，而利玛窦和麦安东神父继续留在肇庆。利玛窦于西元1600年（万历二十八年）5月18日，利玛窦带着庞迪我神父和准备好献给皇帝的礼物再度赴京，并于1601年1月24日抵达北京。进呈自鸣钟、圣经、《万国图志》、大西洋琴等方物，得明神宗万历皇帝的信任。西元1601年，明神宗下诏允许利玛窦等人长居北京。
利玛窦通过向万历皇帝行贿，通过向官员行贿，通过向朝庭官员拉关系，不断拉拢行贿大明朝庭的官员，之后被大明帝国的万历皇帝允许传教并为之修建了教堂。
随之有了徐光启等天主教的在大明的三柱石，天主教在大明的传教也顺利起来。
但偏偏就是在天主教传播事业起步刚刚顺利几年的情况之下，情势徒然逆转，出现了如此大的波折，这哪里是金尼阁能承受了的呢？
（金尼阁自己想不到的是，如果按着历史的轨迹发展下去，他们会发展一位中国历史上第一位信奉天主教的皇帝，那就是崇祯。崇祯帝因而信奉天主教，便诏谕臣下，凡是名字中有“天”字者，都要改掉，以尊敬天主也，可见他对教会的虔诚。）
金尼阁他们回到罗马教庭之后，教宗当然的勃然大怒，认为这是对神最大的背叛。这是赤果果的打脸啊！几十年付出的努力、期待，人力、物力，就这样被明国抛弃，当然让强势的天主教所不能容忍。
而不能容忍的天主教可不是道教一般的清静无为，他们是有实力的！
立即发动了他们第一波的攻势，利用天主教的影响力，集合在中国附近的荷兰、西班牙、葡萄牙、英国的力量，先对明国进行施压，尔后不惜一战！特别是听说了明国还有着建奴之患，教宗更是对威逼明皇就范信心百倍。
故此才有了金尼阁一行。金尼阁对此行更是信心倍增，信誓旦旦的要夺回属于天主教的荣誉来。一旦明皇就范，那必然要迎来天主教在明国传播的顺利进行。
与之一起到了罗马教庭的杨廷筠，听到了这样的消息，杨廷筠是又惊又喜，惊的是罗马教庭竟然如此的强势，不惜发动战争，那样与明国开战，将会有多少明国战士要死于战争？而喜的是天主教没有就此撤出大明，而是排除万难的要回到大明，让自己可以正常的信教。
金尼阁安慰他说，战争只是谈判的筹码而已，以此为威胁手段，使明皇知道，神的代言人在世上是有强大的力量，不容有人随意的诋毁！
为了主的荣耀，所有的信徒都应不惜身死，这方是检验信徒对主的真诚。将天主带给人类﹐并设法减轻他们的痛苦﹐消除社会的不正义。
杨廷筠被天主吸引﹐对主很真诚，在主与大明之间，他最终选择了主。愿意去向大明百姓甚至是世界百姓宣讲圣言，所以他来了。