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1943年6月3日。虽然比历史上晚了一年，但这场注定要名留史册的海战还是爆发了。在6月3日这一天，斯普鲁恩斯的第16特混舰队已经抵达预定位置，正在中途岛的东北方向活动，和历史上相比稍有出入的是，他们的位置更靠北而不是像历史上一样偏东，也就是说他们处于中途岛的北部，比历史上更接近日军的第一航空舰队。
而就在斯普鲁恩斯在积极备战的同时，在中途岛的西南偏西方向，红海军特混舰队也在枕戈待旦。按照战前的部署，红海军应该在中途岛西南方向活动，从历史上看，这个方向并没有日本的主力舰队，反倒是离日本第二舰队也就是进攻中途岛的登陆部队比较近。
说实话，这样的开局一开始就打乱了尼米兹的安排，本来让红海军去中途岛的西南方向的主要原因就是以为日军的航母主力会出现在中途岛的正西方，而在西南方向的红海军能离敌人近一些，以便腿短的雅克-3K能掩护攻击集群打击日本航母。
而实际上，南云忠一的舰队是从中途岛的西北方向插入的，离西南方向的红海军特混舰队是比较远的。也就是说海战还没开打，在布局阶段为了照顾各方面的需求，盟军海军实际上也是在各自为战。而这种配合问题将贯穿中途岛战役始终。
历史上，从中途岛起飞的卡塔琳娜（PBY）首先发现了日本舰队，但是草莓九号侦察机不知道是过于亢奋还是忙中出错竟然只通知中途岛发现了日舰队主力，但是却没有说明这所谓的主力舰队究竟是些什么舰船，这就给当时的战场决策造成了极大的麻烦。
不管是斯普鲁恩斯还是弗莱彻其任务只有一个，就是摧毁日本的航母，这是最核心的，他们的所有行动都只能围绕日本的航母打转转。一旦这个被草莓九号在中途岛正西方向发现的所谓日军主力舰队没有航母，那乐子可就大了！
为什么这么说呢？因为此时弗莱彻和斯普鲁恩斯在中途岛东北方向活动，离中途岛正西的所谓日舰队“主力”太远了，如果想要攻击这个所谓的“主力”舰队。弗莱彻和斯普鲁恩斯必须加速向西运动，根据当时的估算，第16和第17特混舰队全速前进也要日落时分才能抵达攻击阵位。
当然，这不是最重要的。更重要的是，如果这个所谓的主力是子虚乌有的呢？如果这个所谓的“主力”完全是误会呢？如果日舰队真正的主力在其他方向，比如说在中途岛的东北方向呢？
那一旦弗莱彻和斯普鲁恩斯听信了这个情报，向西运动，后果只有一个。正好进入南云忠一的机动舰队的眼皮子底下，等于是送菜上门。
历史也证明草莓九号的报告实在是坑爹，因为他发现的是近藤信竹的第二舰队，也就是将要攻占中途岛的那只舰队。此时真正的日本主力舰队还在东北方向的风暴之中。
当然，我们从事后来看这场决战可以放心大胆的当事后诸葛亮，而当时的战场指挥官进行决策的时候就没有那么轻松了。
敌人的航母是不是还在后面呢？这个问题困扰着尼米兹以及斯普鲁恩斯和弗莱彻，那有没有一种办法能搞清楚这个问题呢？唯一的办法就是继续侦察。
尼米兹将草莓九号的侦察报告送给了库兹涅佐夫，希望红海军舰队能派出侦察机前往该海域进行侦察。前面说了，此时红海军特混舰队的位置是西南偏北，离中途岛大概有150海里。他们离事发地点是比较近的。大航程的Ro-2完全可以超越草莓九号去看一看那所谓的“主力”后面是不是真的有航母存在。
请注意，这是一个拐点，因为红海军接下来的侦察将非常的重要，不客气地说可以决定海战的结局。
与此同时还发生了几件值得注意的事情，第一是近藤信竹也发现了草莓九号的存在，第一时间就打破了无线电沉默，向山本报告他的舰队已经暴露。
同时在中途岛东北海域活动的弗莱彻也是相当的犹豫，草莓九号的情报太让人蛋疼了，是向西南运动打击敌人所谓的“主力”还是继续留在东北海域待机，他相当难下定决心。
蛋疼了一阵之后。弗莱彻觉得还是先侦察吧，约克城号立刻起飞了十家SBD向东北方向侦察，为了保险起见，弗莱彻还特别下令：“这批侦察机只能向东北方向两百海里侦察。而且一旦中途岛那边的卡塔琳娜先一步获得了敌人航母的动向，就必须立刻返回母舰！”
第三件事就是南云忠一终于跟山本取得了联系，按照米号计划原本应该用于侦察中途岛的二式大艇因为无法在预定海域同潜艇汇合加油不得不返航。也就是说此时日本人并不确定美国的航空母舰还呆在珍珠港。而这就给南云忠一的决策造成了极大的困扰。所以当时他一面命令按照计划去空袭中途岛，另一面也弹射水上侦察机进行侦察
从后面的结果看这个决策很糟糕。为什么这么说呢？因为当时的海上侦察都是扇形覆盖，同时起飞一批侦察机，每一架搜索一个小扇面。从而覆盖较大的海域。但是这样的侦察行动有要求，那就是这一批侦察机最好是同时起飞，如果起飞的时间差拉得太长，结果只有一个，那就是会错漏目标。
而此时南云忠一就碰到了这种蛋疼的情况，重巡洋舰利根号的弹射器出了故障，两架水上侦察机延迟了半个小时才起飞。与此同时筑摩号的一架侦察机因为引擎故障也被迫返航，而坑爹的是这三家侦察机前往的海域跟美国舰队息息相关，尤其是筑摩号那架所覆盖的海域，正好是美国海军活动的区域。
当然，站在后来者的角度看，南云在这次的决策中其实还有更大的问题。按道理说，既然知道近藤信竹已经暴露，又知道二式大艇没有完成侦察，不能确定中途岛海域究竟有没有美国特混舰队。那此时他作为机动舰队司令，首先要做的就不应该是去空袭中途岛。哪怕是仅仅派了一小半战机并且把相当部分精锐飞行员留下了，也不应该。
为什么这么说呢？因为从那一刻开始，南云忠一就掉进了一个坑里，究竟是打中途岛还是美国航母。他处于反复被动的挣扎当中。从他这个决策本身来说，似乎就跟米号作战一样准备面面俱到，但问题是日本海军没有面面俱到的能力。
看似留下一多半的精锐飞行员并给剩下的战机装上鱼雷是个办法，一旦等侦察机发现了美国海军就可以立刻出击，与此同时又不耽搁空袭中途岛。似乎是不错。但是细细地想一想，36架舰爆和36架97式舰攻足够搞定中途岛吗？
恐怕是有困难的，而后来空袭行动也证明了这一点，友永丈市大尉后来就报告南云需要对中途岛进行第二波次打击。我们可以试问一下，如果一开始南云就全力出击，恐怕是不需要对中途岛进行补刀了吧？