赫鲁晓夫傲慢的态度以及苏联悍然恢复核试验，这一切都让年轻的肯尼迪总统感到被轻视的痛苦，当u—2侦察飞机拍摄到古巴的导弹基地后，肯尼迪决定在这个问题上寸步不让，要向对手证明他的无畏和坚毅。
根据技术专家送来的报告表明，再过十来天，古巴圣克里斯托瓦尔射场便可供使用，而这一工程完成后．美国在遭到袭击时的报警时间使将从十五分钟缩短到两三分钟。肯尼迪感到“震惊到难以置信的地步”，尽管美国作出任何反应都可能使局势恶化，但总比听任赫鲁晓夫干下去要好一些。
这时候，大多数美国专家还都感到只有一个对策：对古巴导弹射场进行一次空袭。肯尼迪叹息道：“我现在才知道东条在策划偷袭珍珠港时是何种感觉。”
随后，u—2飞机又获得了令人不寒而栗的新证据。苏联技术专家昼夜不停地工作。现在，从照片上已能够看到导弹。一周之内，十六个——也许三十二个射场就可供射之用。除了有确凿证据表明，圣克里朗托瓦尔确有中程导弹(射程一千英里)射场外，还现在圣克里斯托瓦尔和哈瓦那之间的瓜纳哈伊地区以及古巴东部的雷梅迪奥斯，设有远中程导弹(二千二百英里)射场。远中程武器的准备工作将于半个月后完成。
这就是军界所说的“第一次打击”武器。据美国情报委员会估计，苏联用这些武器可以向美国本土(西至蒙大拿州)的目标一次集中射四十枚核弹头。
据美国情报界估计，当前在古巴的武器大约相当于苏联全部洲际弹道导弹射能力的一半。对照片的分析表明，它们是对准着一批特定的美国城市的，如果射出来，几分钟之内八百万美国人就会丧命。肯尼迪总统无奈地对国务卿艾奇逊说道：“这个星期我得对得起我那薪水。”
肯尼迪暂时否决了大数人的意见，那就是进行空袭——当时委婉的说法叫作动一次“外科手术”。他决定先采取另一个方案，对古巴实行海上针锁。轰炸和封锁都是战争行为，但封锁的好处在于，至少在最初阶段，可以避免流血。空袭会炸死大约两万五千名古巴人以及数目难以估计的苏联技术人员。炸死了俄国人．就几乎难免要同苏联打一场全面战争了。
国务院的一位法律顾问回顾到富兰克林?罗斯福“隔离侵略者的讲话”，建议把封锁叫作“隔离”可能会更好一些。肯尼迪极力赞成，并授命司法部副部长卡曾巴赫这位国际法教授为封锁古巴寻找法律上的根据。此时，美国战术空军指挥部的司令官告诉他说，大规模空中偷袭也未必能够消灭古巴的全部导弹射场和核武器，这使肯尼迪对封锁的决定就不再有丝毫犹豫。
“同胞们．晚安。政府遵守自己的诺言，一直对苏联在古巴岛上的军事集结情况保持着极为严密的监视。在过去的一周里，已有确凿无疑的证据表明在那个被禁锢的岛上，正在修建一系列进攻性导弹的射场。修建这些基地的目的，只可能是为了提供向西半球进攻的核打击能力……俄国人的一再许诺，如今看来已显然是蓄意的欺骗，而清除这一核威胁将是我作为美国总统坚定不移的目标。隔离措施仅仅是第一步，必要时还将采取更强有力的措施。美洲国家组织正召开紧急会议考虑应付这个威胁的对策，从古巴射的任何导弹都将被认为是苏联向美国的袭击，必将招致美国对苏联的全面的报复。企图闯越封锁线的任何船只．都将被美国海军击沉……”
当肯尼迪向全国民众作电视演说时，美国已经为进一步采取军事行动准备了足够的军事力量：可以向古巴的目标动向千架次攻击的军用飞机，由九万名海军陆战队和伞兵组成的登陆进攻队伍，以及二十五万名增援部队。美国国防部长估计，在打击古巴的行动中，美国伤亡人数将达两万五千名。
肯尼迪的演说同时用三十八种语言播往世界各地，引起了强烈的反响。美国开始行动，第二次世界大战之后的最严重的战争危机爆了。