更新时间：20-0-5
成为辽东巡抚后的袁崇焕，没有和经略王之臣起冲突，却与军中大将满桂起了冲突，原因只在于满桂骂了他的爱将赵率教怯战胆小。赵率教有怯战的前科——辽沈大战时，赵为辽东经略袁应泰的中军，就有临阵溃退的事迹。
满桂骂得没有错，袁崇焕却袒护赵率教，加恨于满桂。倒是赵率教经满桂这一骂，却是幡然悔悟，在一年之后的宁锦大战中，他在袁崇焕拒不发兵救援的情况下，坚持死守锦州，并最终在满桂的配合下取得锦州大捷。
锦州大捷的含金量远胜袁崇焕的宁远大捷，可谓奇功。虽然在宁锦大战战后的奏报中，袁崇焕把满桂列为首功，但首功其实应当是独守锦州的赵率教。之所以推满桂为锦州大捷的首功，恐怕是袁崇焕有意和满桂和解的缘故。可惜这个结却一直没有化解，直至两年后，文武殊途，一场悲剧——一个战死，一个被千刀万剐。
在与满桂发生冲突时，袁崇焕又与王之臣发生了“经略不和”的老戏码。原因在于袁崇焕坚持要满桂走，王之臣却坚持要留下满桂，二人协商无果，只好把矛盾闹到了朝廷。
朝廷传来的消息却是让王之臣专督关内，叫袁崇焕专督关外，这个态势，倒是回到了熊廷弼和王化贞时期，经抚之间的区划如出一辙。只是有所不同的是，熊王是既成事实未得朝廷承认，袁王之责任划分却是朝廷明文任命了的。这种态势，显然对前线战事不利，而且最重要的是，满桂还是被调到了大同，这无疑是袁崇焕的胜利，王之臣的失败。
可以说，在这次经抚不和中，袁崇焕占了上风。
天启七年正月，皇太极发动丁卯之役，宁锦的局势也开始紧张。有鉴于广宁大战的前事之师，二月，朝廷把蓟辽督师王之臣调任京师兵部尚书。至宁锦大战爆发前，又调任蓟辽总督阎鸣泰坐镇山海关支援宁锦。
蓟辽总督的实际管辖范围就是蓟镇，因此与辽东巡抚的职权范围不冲突。宁锦大战前，关内各镇都抽调了很多援军至山海关协防，其中很多就隶属蓟辽总督管辖。因此，阎鸣泰坐镇山海关，对协调管理关内援军有利，对袁崇焕的指挥不会有牵制作用。此战前敌指挥事权统一，应当也算得是一个有利因素。
宁锦大战后，袁崇焕因党争且意气用事，辞职为民，王之臣复任督师，辽东巡抚则任命了毕自肃。这一届督抚之间却是相对平和，没有闹出什么矛盾。但为时却很短暂。
崇祯元年五月，王之臣失锦州，两个月之后被追究免职。袁崇焕则被再次启用，接替王之臣督师蓟辽。就在袁崇焕刚到任时，发生了一件大事：宁远驻军因欠饷四月而兵变。巡抚毕自肃在这次兵变中重伤，自吻而死。
虽然宁远兵变被袁崇焕以个人威望单骑平息，但是借着这次风波，袁崇焕却向朝廷提出了一个非份的要求——不设巡抚。
袁崇焕提出这样一个要求，理由就是广宁大战中经抚不和导致了极其不堪的后果，所以他不想再发生经抚不和导致败局的悲剧。
崇祯对袁崇焕极其信任，也极其倚重他，没有多想便当即接受。由此，袁崇焕任督师时，属下只有三位总兵，没有文职巡抚牵制，独掌辽事大权。可以说，他一手掌控了辽事，没人能对他的决定说一个不字。在此期间，发生了袁崇焕擅自与后金议和，并资助粮食，分崩蒙古诸部，寒朝鲜国心，杀毛文龙等大事。