孟秋时节，豪格于峄县外运河边设坛祭天，斩杀从济南追回的马佳阿思哈和几名正蓝旗逃跑的梅勒章京祭旗，随后留汉军旗一部留守山东、掩护后路，领正蓝旗、汉军旗、左部残军改编的新编绿营十余万人马水陆兵进，南征残明，掀起了这场全天下都等待已久的大战。
扬州之战，是从双方水师的交锋开始的，清军先锋乘船顺运河顺流而下，试图突袭扬州水门，在瓦窖铺遇上了何刚统领的残明水师和驻守此处的忠贯营应廷吉部。
应廷吉与何刚在此处准备良久，凿沉漕船堵塞运河，又以瓦窖铺为中心沿着运河广设炮台布置各式火炮，甚至连投石机都打造了三百多具，将瓦窖铺一线的运河水面完全封锁起来。
尚可喜所部水师习惯了在广阔的登辽海面作战，对于在运河这种相对狭小的区域作战不怎么熟悉，又不熟悉运河水文情况，在清理运河中沉船时便有船只搁浅，导致船队队形混乱，应廷吉趁机集中火炮轰击清军船队，清军被击毁击沉战船七八艘，被迫撤离瓦窖铺一线运河，躲藏在明军的火炮射程之外。
何刚趁机对清军船队发起冲击，希望将清军水师驱走，但何刚手下长江水师兵马也是一支拼凑之师，乃是长江水师、运河护军漕丁和一些新募渔民组成，在陆师的掩护下还能一战，可是堂堂正正和清军水师对阵时，却根本不是对手，何刚损失了几十艘船舰，自知不敌，只能引兵撤回瓦窖铺的运河水面。
一日后，清军陆上先锋也沿运河而下飞马赶到瓦窖铺，统帅这支清军陆师先锋的吴学礼所部当初就驻扎在瓦窖铺一带，对此地极为熟悉，吴学礼分兵切断明军各处炮台的联系，一个个拔除掉明军的外围阵地、挤压明军的防御。
应廷吉见吴学礼用兵谨慎、实在无机可趁，加之清军陆续赶来，明军无力抵挡，便与何刚商议，两人已经完成了孙传庭让他们拖延清军水师的任务，便放弃瓦窖铺领军退入邵伯湖，驻军卢家嘴，与邵伯镇的胡尚友、韩尚谅等部互相策应，以遮断运河、屏障扬州。
吴学礼便在水师的协助下分兵攻打卢家嘴和邵伯镇，两军在邵伯湖上和陆上交战几回，互有伤亡。
数日后，豪格亲领大军赶到扬州近郊，命金声桓、张应祥、郝效忠等左部将领领本部兵马前去协助吴学礼，又分出骑兵四下抄掠村寨，随后领军直抵扬州城下扎营，营帐兵马无边无际，豪格又令人在各营四处插满旗帜，日夜擂鼓吹号，大造声势，试图以此动摇明军军心和坚守的决心。
“阮大铖已经去了扬州劝降孙传庭了......”豪格骑着一匹毛色黝黑的雄健战马，深蓝的棉甲裹得严严实实，缓缓绕着扬州城的防线踱马：“阮大铖在残明为官之时，和孙传庭是政敌，又犯下了诛九族的谋逆之罪，最后又投奔了咱们，本王以为孙传庭会直接一炮轰了他，没想到竟然让他入了城，洪先生，孙传庭似乎也没有坚守的决心啊？”