这一场清洗一直持续到1643年，在此期间朝廷虽然尝试过与许心素达成和解，但依然无法阻止许心素在当地的为所欲为。北方与满清的冲突断断续续，让大明根本无法再抽出足够的兵力来应付南方的内乱。更何况一旦南方开战，与许心素同气连枝的海汉很可能也会同步动手，到时候失去了恐怕就不只是一个福建而已了。
在南北两边都开始吞并大明的时候，位于浙江的石迪文也不甘寂寞，但执委会不同意对浙江大肆出手，因为海汉还需要通过这个地区将大量商品输入到大明内陆的长江流域，并由此获得各种物资和原材料，一旦引发战事可能会使得贸易长期中断。
无奈之下，石迪文也只能再次将主意打到了海对面的日本。1643年春，兵强马壮的东海舰队再次出兵日本，对正在重建中的平户岛又进行了一轮清洗。
此时的东海舰队编制已经不仅仅只有海军，还有两个营的陆军一同跨海出征。以这样的兵力配置拿下刚刚恢复了几分元气的平户岛自然不在话下。不过对于部队在当地俘虏的大量日本人，石迪文也没打算将其全部运回土地有限的舟山岛进行安置，而是在战斗结束后挥师南下，直接去占领了让军方心心念念多年的佐世保湾。
石迪文的目的很明确，既然浙江这边的拓展范围有限，要想继续扩大控制范围，那就只能对别国下手了。而他与北方的陈一鑫之间已经达成了某种默契，朝鲜半岛以北地区归陈一鑫，以南则由石迪文负责。而南边的台湾岛是由执委会直接管理，石迪文不能插手，自然就只能把主意打到日本头上。
舟山当局自行负责整个行动的一半经费，因此执委会也就没有对此提出反对意见。而佐世保湾纳入治下后，石迪文便可以此为基础，逐步控制日本的进出口贸易，并且还能就近引入人口，长远来看肯定是划算的买卖。
而且在佐世保湾设立军事基地后，石迪文也有更为充分的理由继续扩大东海舰队的编制。日本列岛虽然自然资源贫乏，但也足以供养一支活动范围足以辐射整个西太平洋的强大舰队了。
1644年，海汉在南海展开了更大的动作。
马尼拉当局出兵南下，对棉兰老岛和苏禄海地区残余的西班牙殖民点进行了扫荡，并接管了棉兰老岛南端萨兰加尼湾内的西班牙殖民地，向该地区迁入了一千五百余名汉人移民。
马六甲海峡方向，罗杰率部自星岛南下，直抵巽他海峡，攻占了苏门答腊岛南端的班达楠榜。这里原本只是属于亚齐国的一个小海港，不过由海汉控制此地之后，由印度洋进入爪哇海和南海的南方航道就不再只是荷兰东印度公司一家独享的资源了。